Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1U1

Cog4, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog4Q8R1U1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cog4Q8R1U1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cog4Q8R1U1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cog4Q8R1U1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cog4Q8R1U1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cog4Q8R1U1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cog4Q8R1U1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cog4Q8R1U1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cog4Q8R1U1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cog4Q8R1U1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cog4Q8R1U1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cog4Q8R1U1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cog4Q8R1U1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cog4Q8R1U1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cog4Q8R1U1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cog4Q8R1U1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cog4Q8R1U1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cog4Q8R1U1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cog4Q8R1U1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cog4Q8R1U1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cog4Q8R1U1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cog4Q8R1U1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cog4Q8R1U1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cog4Q8R1U1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cog4Q8R1U1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cog4Q8R1U1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cog4Q8R1U1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cog4Q8R1U1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cog4Q8R1U1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cog4Q8R1U1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cog4Q8R1U1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cog4Q8R1U1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cog4Q8R1U1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cog4Q8R1U1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cog4Q8R1U1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cog4Q8R1U1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cog4Q8R1U1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cog4Q8R1U1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cog4Q8R1U1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cog4Q8R1U1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cog4Q8R1U1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cog4Q8R1U1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cog4Q8R1U1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cog4Q8R1U1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cog4Q8R1U1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cog4Q8R1U1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cog4Q8R1U1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cog4Q8R1U1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cog4Q8R1U1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cog4Q8R1U1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cog4Q8R1U1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cog4Q8R1U1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cog4Q8R1U1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cog4Q8R1U1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cog4Q8R1U1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cog4Q8R1U1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cog4Q8R1U1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cog4Q8R1U1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cog4Q8R1U1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cog4Q8R1U1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cog4Q8R1U1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cog4Q8R1U1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cog4Q8R1U1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cog4Q8R1U1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cog4Q8R1U1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cog4Q8R1U1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cog4Q8R1U1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cog4Q8R1U1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cog4Q8R1U1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cog4Q8R1U1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cog4Q8R1U1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cog4Q8R1U1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cog4Q8R1U1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cog4Q8R1U1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cog4Q8R1U1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cog4Q8R1U1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cog4Q8R1U1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cog4Q8R1U1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cog4Q8R1U1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cog4Q8R1U1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cog4Q8R1U1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cog4Q8R1U1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cog4Q8R1U1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cog4Q8R1U1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cog4Q8R1U1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cog4Q8R1U1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cog4Q8R1U1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cog4Q8R1U1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cog4Q8R1U1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cog4Q8R1U1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cog4Q8R1U1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cog4Q8R1U1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cog4Q8R1U1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cog4Q8R1U1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cog4Q8R1U1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cog4Q8R1U1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cog4Q8R1U1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cog4Q8R1U1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cog4Q8R1U1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cog4Q8R1U1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms