Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1Q0

Stx19, Syntaxin-19, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx19Q8R1Q0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stx19Q8R1Q0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stx19Q8R1Q0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stx19Q8R1Q0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stx19Q8R1Q0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stx19Q8R1Q0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stx19Q8R1Q0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Stx19Q8R1Q0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stx19Q8R1Q0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stx19Q8R1Q0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stx19Q8R1Q0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stx19Q8R1Q0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stx19Q8R1Q0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stx19Q8R1Q0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stx19Q8R1Q0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stx19Q8R1Q0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stx19Q8R1Q0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stx19Q8R1Q0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stx19Q8R1Q0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stx19Q8R1Q0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stx19Q8R1Q0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stx19Q8R1Q0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stx19Q8R1Q0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stx19Q8R1Q0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stx19Q8R1Q0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stx19Q8R1Q0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stx19Q8R1Q0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stx19Q8R1Q0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stx19Q8R1Q0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stx19Q8R1Q0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stx19Q8R1Q0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stx19Q8R1Q0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stx19Q8R1Q0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stx19Q8R1Q0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stx19Q8R1Q0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stx19Q8R1Q0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stx19Q8R1Q0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stx19Q8R1Q0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stx19Q8R1Q0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stx19Q8R1Q0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stx19Q8R1Q0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stx19Q8R1Q0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stx19Q8R1Q0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stx19Q8R1Q0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stx19Q8R1Q0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stx19Q8R1Q0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stx19Q8R1Q0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stx19Q8R1Q0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stx19Q8R1Q0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stx19Q8R1Q0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stx19Q8R1Q0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stx19Q8R1Q0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stx19Q8R1Q0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Stx19Q8R1Q0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stx19Q8R1Q0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stx19Q8R1Q0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stx19Q8R1Q0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Stx19Q8R1Q0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stx19Q8R1Q0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stx19Q8R1Q0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stx19Q8R1Q0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stx19Q8R1Q0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stx19Q8R1Q0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stx19Q8R1Q0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Stx19Q8R1Q0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stx19Q8R1Q0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stx19Q8R1Q0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Stx19Q8R1Q0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stx19Q8R1Q0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stx19Q8R1Q0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stx19Q8R1Q0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stx19Q8R1Q0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stx19Q8R1Q0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stx19Q8R1Q0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stx19Q8R1Q0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Stx19Q8R1Q0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stx19Q8R1Q0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stx19Q8R1Q0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stx19Q8R1Q0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Stx19Q8R1Q0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stx19Q8R1Q0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stx19Q8R1Q0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stx19Q8R1Q0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stx19Q8R1Q0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stx19Q8R1Q0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stx19Q8R1Q0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stx19Q8R1Q0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stx19Q8R1Q0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stx19Q8R1Q0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stx19Q8R1Q0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stx19Q8R1Q0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stx19Q8R1Q0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stx19Q8R1Q0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stx19Q8R1Q0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stx19Q8R1Q0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stx19Q8R1Q0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Stx19Q8R1Q0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stx19Q8R1Q0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stx19Q8R1Q0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stx19Q8R1Q0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms