Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1B4

Eif3c, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3cQ8R1B4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Eif3cQ8R1B4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Eif3cQ8R1B4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Eif3cQ8R1B4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Eif3cQ8R1B4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Eif3cQ8R1B4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Eif3cQ8R1B4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Eif3cQ8R1B4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Eif3cQ8R1B4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Eif3cQ8R1B4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Eif3cQ8R1B4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Eif3cQ8R1B4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Eif3cQ8R1B4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Eif3cQ8R1B4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Eif3cQ8R1B4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Eif3cQ8R1B4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Eif3cQ8R1B4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Eif3cQ8R1B4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Eif3cQ8R1B4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Eif3cQ8R1B4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Eif3cQ8R1B4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Eif3cQ8R1B4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Eif3cQ8R1B4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Eif3cQ8R1B4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Eif3cQ8R1B4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Eif3cQ8R1B4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Eif3cQ8R1B4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Eif3cQ8R1B4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Eif3cQ8R1B4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Eif3cQ8R1B4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Eif3cQ8R1B4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Eif3cQ8R1B4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Eif3cQ8R1B4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Eif3cQ8R1B4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Eif3cQ8R1B4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Eif3cQ8R1B4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Eif3cQ8R1B4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Eif3cQ8R1B4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Eif3cQ8R1B4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Eif3cQ8R1B4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Eif3cQ8R1B4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Eif3cQ8R1B4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Eif3cQ8R1B4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Eif3cQ8R1B4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Eif3cQ8R1B4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Eif3cQ8R1B4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Eif3cQ8R1B4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Eif3cQ8R1B4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Eif3cQ8R1B4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Eif3cQ8R1B4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Eif3cQ8R1B4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Eif3cQ8R1B4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Eif3cQ8R1B4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Eif3cQ8R1B4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Eif3cQ8R1B4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Eif3cQ8R1B4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Eif3cQ8R1B4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Eif3cQ8R1B4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Eif3cQ8R1B4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Eif3cQ8R1B4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Eif3cQ8R1B4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Eif3cQ8R1B4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Eif3cQ8R1B4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Eif3cQ8R1B4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Eif3cQ8R1B4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Eif3cQ8R1B4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Eif3cQ8R1B4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Eif3cQ8R1B4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Eif3cQ8R1B4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Eif3cQ8R1B4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Eif3cQ8R1B4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Eif3cQ8R1B4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Eif3cQ8R1B4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Eif3cQ8R1B4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Eif3cQ8R1B4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Eif3cQ8R1B4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Eif3cQ8R1B4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Eif3cQ8R1B4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Eif3cQ8R1B4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Eif3cQ8R1B4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Eif3cQ8R1B4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Eif3cQ8R1B4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Eif3cQ8R1B4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Eif3cQ8R1B4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Eif3cQ8R1B4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Eif3cQ8R1B4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Eif3cQ8R1B4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Eif3cQ8R1B4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Eif3cQ8R1B4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Eif3cQ8R1B4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Eif3cQ8R1B4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Eif3cQ8R1B4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Eif3cQ8R1B4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Eif3cQ8R1B4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Eif3cQ8R1B4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Eif3cQ8R1B4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Eif3cQ8R1B4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Eif3cQ8R1B4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Eif3cQ8R1B4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Eif3cQ8R1B4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms