Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0J7

Vps37b, Vacuolar protein sorting-associated protein 37B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps37bQ8R0J7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps37bQ8R0J7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps37bQ8R0J7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps37bQ8R0J7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps37bQ8R0J7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps37bQ8R0J7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps37bQ8R0J7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps37bQ8R0J7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps37bQ8R0J7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps37bQ8R0J7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps37bQ8R0J7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps37bQ8R0J7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps37bQ8R0J7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps37bQ8R0J7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps37bQ8R0J7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps37bQ8R0J7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps37bQ8R0J7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps37bQ8R0J7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps37bQ8R0J7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps37bQ8R0J7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps37bQ8R0J7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps37bQ8R0J7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps37bQ8R0J7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps37bQ8R0J7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Vps37bQ8R0J7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Vps37bQ8R0J7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Vps37bQ8R0J7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vps37bQ8R0J7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vps37bQ8R0J7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps37bQ8R0J7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps37bQ8R0J7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps37bQ8R0J7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps37bQ8R0J7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps37bQ8R0J7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps37bQ8R0J7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps37bQ8R0J7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps37bQ8R0J7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps37bQ8R0J7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps37bQ8R0J7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps37bQ8R0J7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps37bQ8R0J7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps37bQ8R0J7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps37bQ8R0J7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps37bQ8R0J7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps37bQ8R0J7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vps37bQ8R0J7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vps37bQ8R0J7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vps37bQ8R0J7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vps37bQ8R0J7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps37bQ8R0J7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps37bQ8R0J7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps37bQ8R0J7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps37bQ8R0J7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps37bQ8R0J7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps37bQ8R0J7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps37bQ8R0J7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps37bQ8R0J7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps37bQ8R0J7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps37bQ8R0J7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps37bQ8R0J7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps37bQ8R0J7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps37bQ8R0J7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps37bQ8R0J7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps37bQ8R0J7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps37bQ8R0J7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps37bQ8R0J7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps37bQ8R0J7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps37bQ8R0J7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps37bQ8R0J7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps37bQ8R0J7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vps37bQ8R0J7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vps37bQ8R0J7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vps37bQ8R0J7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vps37bQ8R0J7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vps37bQ8R0J7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Vps37bQ8R0J7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vps37bQ8R0J7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vps37bQ8R0J7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vps37bQ8R0J7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vps37bQ8R0J7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps37bQ8R0J7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps37bQ8R0J7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps37bQ8R0J7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps37bQ8R0J7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps37bQ8R0J7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps37bQ8R0J7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vps37bQ8R0J7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vps37bQ8R0J7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vps37bQ8R0J7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vps37bQ8R0J7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vps37bQ8R0J7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vps37bQ8R0J7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vps37bQ8R0J7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vps37bQ8R0J7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vps37bQ8R0J7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vps37bQ8R0J7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vps37bQ8R0J7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vps37bQ8R0J7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vps37bQ8R0J7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vps37bQ8R0J7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms