Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0H9

Gga1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, mousemouse

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga1Q8R0H9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gga1Q8R0H9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gga1Q8R0H9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Gga1Q8R0H9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Gga1Q8R0H9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Gga1Q8R0H9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gga1Q8R0H9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gga1Q8R0H9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gga1Q8R0H9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gga1Q8R0H9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gga1Q8R0H9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gga1Q8R0H9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gga1Q8R0H9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gga1Q8R0H9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gga1Q8R0H9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Gga1Q8R0H9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gga1Q8R0H9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gga1Q8R0H9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gga1Q8R0H9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gga1Q8R0H9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gga1Q8R0H9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Gga1Q8R0H9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gga1Q8R0H9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gga1Q8R0H9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gga1Q8R0H9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gga1Q8R0H9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gga1Q8R0H9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gga1Q8R0H9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gga1Q8R0H9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gga1Q8R0H9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gga1Q8R0H9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Gga1Q8R0H9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gga1Q8R0H9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gga1Q8R0H9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gga1Q8R0H9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gga1Q8R0H9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gga1Q8R0H9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gga1Q8R0H9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gga1Q8R0H9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gga1Q8R0H9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gga1Q8R0H9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gga1Q8R0H9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gga1Q8R0H9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Gga1Q8R0H9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gga1Q8R0H9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Gga1Q8R0H9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gga1Q8R0H9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Gga1Q8R0H9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gga1Q8R0H9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gga1Q8R0H9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gga1Q8R0H9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gga1Q8R0H9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Gga1Q8R0H9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gga1Q8R0H9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Gga1Q8R0H9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gga1Q8R0H9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gga1Q8R0H9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gga1Q8R0H9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gga1Q8R0H9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Gga1Q8R0H9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gga1Q8R0H9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gga1Q8R0H9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gga1Q8R0H9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gga1Q8R0H9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gga1Q8R0H9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gga1Q8R0H9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gga1Q8R0H9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gga1Q8R0H9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gga1Q8R0H9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gga1Q8R0H9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gga1Q8R0H9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gga1Q8R0H9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Gga1Q8R0H9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gga1Q8R0H9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gga1Q8R0H9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gga1Q8R0H9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gga1Q8R0H9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gga1Q8R0H9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gga1Q8R0H9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gga1Q8R0H9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Gga1Q8R0H9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gga1Q8R0H9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gga1Q8R0H9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gga1Q8R0H9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Gga1Q8R0H9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Gga1Q8R0H9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gga1Q8R0H9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gga1Q8R0H9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gga1Q8R0H9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gga1Q8R0H9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gga1Q8R0H9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gga1Q8R0H9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gga1Q8R0H9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gga1Q8R0H9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gga1Q8R0H9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gga1Q8R0H9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gga1Q8R0H9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gga1Q8R0H9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gga1Q8R0H9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gga1Q8R0H9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms