Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0F3

Sumf1, Sulfatase-modifying factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumf1Q8R0F3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Sumf1Q8R0F3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Sumf1Q8R0F3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Sumf1Q8R0F3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Sumf1Q8R0F3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Sumf1Q8R0F3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Sumf1Q8R0F3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Sumf1Q8R0F3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Sumf1Q8R0F3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Sumf1Q8R0F3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Sumf1Q8R0F3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Sumf1Q8R0F3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Sumf1Q8R0F3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Sumf1Q8R0F3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Sumf1Q8R0F3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Sumf1Q8R0F3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Sumf1Q8R0F3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Sumf1Q8R0F3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Sumf1Q8R0F3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Sumf1Q8R0F3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Sumf1Q8R0F3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Sumf1Q8R0F3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Sumf1Q8R0F3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Sumf1Q8R0F3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Sumf1Q8R0F3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Sumf1Q8R0F3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Sumf1Q8R0F3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Sumf1Q8R0F3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Sumf1Q8R0F3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Sumf1Q8R0F3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sumf1Q8R0F3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sumf1Q8R0F3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sumf1Q8R0F3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sumf1Q8R0F3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sumf1Q8R0F3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Sumf1Q8R0F3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Sumf1Q8R0F3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Sumf1Q8R0F3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sumf1Q8R0F3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Sumf1Q8R0F3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sumf1Q8R0F3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Sumf1Q8R0F3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Sumf1Q8R0F3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Sumf1Q8R0F3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Sumf1Q8R0F3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Sumf1Q8R0F3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Sumf1Q8R0F3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Sumf1Q8R0F3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Sumf1Q8R0F3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Sumf1Q8R0F3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Sumf1Q8R0F3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Sumf1Q8R0F3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sumf1Q8R0F3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sumf1Q8R0F3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sumf1Q8R0F3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sumf1Q8R0F3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sumf1Q8R0F3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sumf1Q8R0F3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Sumf1Q8R0F3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sumf1Q8R0F3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sumf1Q8R0F3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sumf1Q8R0F3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sumf1Q8R0F3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sumf1Q8R0F3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sumf1Q8R0F3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sumf1Q8R0F3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sumf1Q8R0F3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sumf1Q8R0F3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sumf1Q8R0F3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Sumf1Q8R0F3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sumf1Q8R0F3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sumf1Q8R0F3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sumf1Q8R0F3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sumf1Q8R0F3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sumf1Q8R0F3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sumf1Q8R0F3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sumf1Q8R0F3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sumf1Q8R0F3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Sumf1Q8R0F3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Sumf1Q8R0F3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Sumf1Q8R0F3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Sumf1Q8R0F3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Sumf1Q8R0F3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Sumf1Q8R0F3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Sumf1Q8R0F3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Sumf1Q8R0F3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sumf1Q8R0F3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sumf1Q8R0F3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sumf1Q8R0F3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sumf1Q8R0F3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sumf1Q8R0F3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sumf1Q8R0F3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Sumf1Q8R0F3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Sumf1Q8R0F3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sumf1Q8R0F3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sumf1Q8R0F3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Sumf1Q8R0F3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Sumf1Q8R0F3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sumf1Q8R0F3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Sumf1Q8R0F3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms