Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sf3b4Q8QZY9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sf3b4Q8QZY9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sf3b4Q8QZY9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sf3b4Q8QZY9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sf3b4Q8QZY9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sf3b4Q8QZY9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sf3b4Q8QZY9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sf3b4Q8QZY9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sf3b4Q8QZY9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sf3b4Q8QZY9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sf3b4Q8QZY9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sf3b4Q8QZY9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sf3b4Q8QZY9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sf3b4Q8QZY9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sf3b4Q8QZY9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sf3b4Q8QZY9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sf3b4Q8QZY9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sf3b4Q8QZY9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Sf3b4Q8QZY9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sf3b4Q8QZY9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sf3b4Q8QZY9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sf3b4Q8QZY9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sf3b4Q8QZY9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sf3b4Q8QZY9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sf3b4Q8QZY9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sf3b4Q8QZY9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sf3b4Q8QZY9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sf3b4Q8QZY9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sf3b4Q8QZY9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sf3b4Q8QZY9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sf3b4Q8QZY9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sf3b4Q8QZY9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sf3b4Q8QZY9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sf3b4Q8QZY9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sf3b4Q8QZY9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Sf3b4Q8QZY9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sf3b4Q8QZY9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Sf3b4Q8QZY9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sf3b4Q8QZY9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sf3b4Q8QZY9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sf3b4Q8QZY9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sf3b4Q8QZY9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sf3b4Q8QZY9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sf3b4Q8QZY9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sf3b4Q8QZY9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sf3b4Q8QZY9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sf3b4Q8QZY9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sf3b4Q8QZY9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sf3b4Q8QZY9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sf3b4Q8QZY9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sf3b4Q8QZY9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sf3b4Q8QZY9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sf3b4Q8QZY9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sf3b4Q8QZY9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sf3b4Q8QZY9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sf3b4Q8QZY9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sf3b4Q8QZY9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sf3b4Q8QZY9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sf3b4Q8QZY9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sf3b4Q8QZY9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sf3b4Q8QZY9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sf3b4Q8QZY9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sf3b4Q8QZY9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sf3b4Q8QZY9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sf3b4Q8QZY9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Sf3b4Q8QZY9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Sf3b4Q8QZY9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Sf3b4Q8QZY9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Sf3b4Q8QZY9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sf3b4Q8QZY9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sf3b4Q8QZY9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sf3b4Q8QZY9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sf3b4Q8QZY9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sf3b4Q8QZY9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sf3b4Q8QZY9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sf3b4Q8QZY9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sf3b4Q8QZY9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sf3b4Q8QZY9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sf3b4Q8QZY9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sf3b4Q8QZY9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Sf3b4Q8QZY9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sf3b4Q8QZY9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sf3b4Q8QZY9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sf3b4Q8QZY9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sf3b4Q8QZY9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sf3b4Q8QZY9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sf3b4Q8QZY9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sf3b4Q8QZY9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sf3b4Q8QZY9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sf3b4Q8QZY9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sf3b4Q8QZY9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sf3b4Q8QZY9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sf3b4Q8QZY9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sf3b4Q8QZY9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sf3b4Q8QZY9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sf3b4Q8QZY9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sf3b4Q8QZY9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sf3b4Q8QZY9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sf3b4Q8QZY9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms