Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxc12Q8K5B8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxc12Q8K5B8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxc12Q8K5B8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxc12Q8K5B8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxc12Q8K5B8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxc12Q8K5B8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxc12Q8K5B8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxc12Q8K5B8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxc12Q8K5B8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxc12Q8K5B8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxc12Q8K5B8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxc12Q8K5B8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc12Q8K5B8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc12Q8K5B8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc12Q8K5B8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxc12Q8K5B8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxc12Q8K5B8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxc12Q8K5B8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxc12Q8K5B8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxc12Q8K5B8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxc12Q8K5B8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxc12Q8K5B8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxc12Q8K5B8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxc12Q8K5B8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxc12Q8K5B8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxc12Q8K5B8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxc12Q8K5B8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxc12Q8K5B8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxc12Q8K5B8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxc12Q8K5B8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxc12Q8K5B8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxc12Q8K5B8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxc12Q8K5B8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxc12Q8K5B8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc12Q8K5B8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc12Q8K5B8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc12Q8K5B8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc12Q8K5B8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc12Q8K5B8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc12Q8K5B8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc12Q8K5B8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc12Q8K5B8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxc12Q8K5B8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxc12Q8K5B8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxc12Q8K5B8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxc12Q8K5B8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxc12Q8K5B8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxc12Q8K5B8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxc12Q8K5B8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxc12Q8K5B8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxc12Q8K5B8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxc12Q8K5B8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxc12Q8K5B8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxc12Q8K5B8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxc12Q8K5B8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxc12Q8K5B8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxc12Q8K5B8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxc12Q8K5B8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hoxc12Q8K5B8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxc12Q8K5B8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxc12Q8K5B8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxc12Q8K5B8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxc12Q8K5B8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc12Q8K5B8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc12Q8K5B8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc12Q8K5B8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc12Q8K5B8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc12Q8K5B8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc12Q8K5B8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc12Q8K5B8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc12Q8K5B8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc12Q8K5B8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc12Q8K5B8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxc12Q8K5B8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxc12Q8K5B8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxc12Q8K5B8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxc12Q8K5B8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxc12Q8K5B8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxc12Q8K5B8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxc12Q8K5B8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxc12Q8K5B8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxc12Q8K5B8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxc12Q8K5B8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxc12Q8K5B8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxc12Q8K5B8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxc12Q8K5B8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxc12Q8K5B8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxc12Q8K5B8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxc12Q8K5B8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxc12Q8K5B8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxc12Q8K5B8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxc12Q8K5B8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxc12Q8K5B8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxc12Q8K5B8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxc12Q8K5B8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxc12Q8K5B8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxc12Q8K5B8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxc12Q8K5B8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxc12Q8K5B8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms