Protein–RNA interactions for Protein: Q8K297

Colgalt1, Procollagen galactosyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colgalt1Q8K297 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Colgalt1Q8K297 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Colgalt1Q8K297 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Colgalt1Q8K297 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Colgalt1Q8K297 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Colgalt1Q8K297 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Colgalt1Q8K297 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Colgalt1Q8K297 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Colgalt1Q8K297 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Colgalt1Q8K297 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Colgalt1Q8K297 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Colgalt1Q8K297 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Colgalt1Q8K297 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Colgalt1Q8K297 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Colgalt1Q8K297 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Colgalt1Q8K297 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Colgalt1Q8K297 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Colgalt1Q8K297 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Colgalt1Q8K297 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Colgalt1Q8K297 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Colgalt1Q8K297 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Colgalt1Q8K297 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Colgalt1Q8K297 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Colgalt1Q8K297 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Colgalt1Q8K297 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Colgalt1Q8K297 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Colgalt1Q8K297 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Colgalt1Q8K297 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Colgalt1Q8K297 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Colgalt1Q8K297 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Colgalt1Q8K297 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Colgalt1Q8K297 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Colgalt1Q8K297 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Colgalt1Q8K297 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Colgalt1Q8K297 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Colgalt1Q8K297 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Colgalt1Q8K297 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Colgalt1Q8K297 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Colgalt1Q8K297 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Colgalt1Q8K297 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Colgalt1Q8K297 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Colgalt1Q8K297 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Colgalt1Q8K297 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Colgalt1Q8K297 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Colgalt1Q8K297 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Colgalt1Q8K297 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Colgalt1Q8K297 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Colgalt1Q8K297 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Colgalt1Q8K297 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Colgalt1Q8K297 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Colgalt1Q8K297 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Colgalt1Q8K297 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Colgalt1Q8K297 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Colgalt1Q8K297 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Colgalt1Q8K297 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Colgalt1Q8K297 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Colgalt1Q8K297 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Colgalt1Q8K297 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Colgalt1Q8K297 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Colgalt1Q8K297 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Colgalt1Q8K297 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Colgalt1Q8K297 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Colgalt1Q8K297 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Colgalt1Q8K297 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Colgalt1Q8K297 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Colgalt1Q8K297 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Colgalt1Q8K297 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Colgalt1Q8K297 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Colgalt1Q8K297 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Colgalt1Q8K297 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Colgalt1Q8K297 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Colgalt1Q8K297 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Colgalt1Q8K297 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Colgalt1Q8K297 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Colgalt1Q8K297 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Colgalt1Q8K297 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Colgalt1Q8K297 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Colgalt1Q8K297 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Colgalt1Q8K297 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Colgalt1Q8K297 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Colgalt1Q8K297 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Colgalt1Q8K297 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Colgalt1Q8K297 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Colgalt1Q8K297 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Colgalt1Q8K297 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Colgalt1Q8K297 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Colgalt1Q8K297 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Colgalt1Q8K297 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Colgalt1Q8K297 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Colgalt1Q8K297 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Colgalt1Q8K297 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Colgalt1Q8K297 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Colgalt1Q8K297 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Colgalt1Q8K297 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Colgalt1Q8K297 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Colgalt1Q8K297 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Colgalt1Q8K297 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Colgalt1Q8K297 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Colgalt1Q8K297 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Colgalt1Q8K297 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 154.1 ms