Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf3c1Q8K284 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf3c1Q8K284 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf3c1Q8K284 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf3c1Q8K284 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf3c1Q8K284 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf3c1Q8K284 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf3c1Q8K284 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf3c1Q8K284 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf3c1Q8K284 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf3c1Q8K284 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gtf3c1Q8K284 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf3c1Q8K284 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf3c1Q8K284 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf3c1Q8K284 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf3c1Q8K284 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf3c1Q8K284 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf3c1Q8K284 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf3c1Q8K284 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf3c1Q8K284 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf3c1Q8K284 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf3c1Q8K284 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf3c1Q8K284 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtf3c1Q8K284 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtf3c1Q8K284 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtf3c1Q8K284 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtf3c1Q8K284 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf3c1Q8K284 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gtf3c1Q8K284 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf3c1Q8K284 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf3c1Q8K284 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf3c1Q8K284 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf3c1Q8K284 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf3c1Q8K284 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf3c1Q8K284 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf3c1Q8K284 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf3c1Q8K284 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf3c1Q8K284 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf3c1Q8K284 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf3c1Q8K284 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf3c1Q8K284 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf3c1Q8K284 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf3c1Q8K284 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf3c1Q8K284 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf3c1Q8K284 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf3c1Q8K284 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf3c1Q8K284 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf3c1Q8K284 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf3c1Q8K284 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf3c1Q8K284 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf3c1Q8K284 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gtf3c1Q8K284 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf3c1Q8K284 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf3c1Q8K284 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf3c1Q8K284 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf3c1Q8K284 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf3c1Q8K284 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf3c1Q8K284 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf3c1Q8K284 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf3c1Q8K284 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf3c1Q8K284 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf3c1Q8K284 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtf3c1Q8K284 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtf3c1Q8K284 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtf3c1Q8K284 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtf3c1Q8K284 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf3c1Q8K284 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf3c1Q8K284 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf3c1Q8K284 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf3c1Q8K284 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf3c1Q8K284 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf3c1Q8K284 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf3c1Q8K284 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf3c1Q8K284 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf3c1Q8K284 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf3c1Q8K284 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf3c1Q8K284 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf3c1Q8K284 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf3c1Q8K284 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf3c1Q8K284 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf3c1Q8K284 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf3c1Q8K284 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf3c1Q8K284 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf3c1Q8K284 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf3c1Q8K284 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf3c1Q8K284 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf3c1Q8K284 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf3c1Q8K284 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf3c1Q8K284 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf3c1Q8K284 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf3c1Q8K284 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf3c1Q8K284 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf3c1Q8K284 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf3c1Q8K284 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf3c1Q8K284 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf3c1Q8K284 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf3c1Q8K284 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf3c1Q8K284 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf3c1Q8K284 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf3c1Q8K284 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms