Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Polr1eQ8K202 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Polr1eQ8K202 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Polr1eQ8K202 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Polr1eQ8K202 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Polr1eQ8K202 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Polr1eQ8K202 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Polr1eQ8K202 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Polr1eQ8K202 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Polr1eQ8K202 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Polr1eQ8K202 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Polr1eQ8K202 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Polr1eQ8K202 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Polr1eQ8K202 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Polr1eQ8K202 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Polr1eQ8K202 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Polr1eQ8K202 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Polr1eQ8K202 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Polr1eQ8K202 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Polr1eQ8K202 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Polr1eQ8K202 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Polr1eQ8K202 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Polr1eQ8K202 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Polr1eQ8K202 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Polr1eQ8K202 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Polr1eQ8K202 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Polr1eQ8K202 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Polr1eQ8K202 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Polr1eQ8K202 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Polr1eQ8K202 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Polr1eQ8K202 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Polr1eQ8K202 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Polr1eQ8K202 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Polr1eQ8K202 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Polr1eQ8K202 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Polr1eQ8K202 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Polr1eQ8K202 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Polr1eQ8K202 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Polr1eQ8K202 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Polr1eQ8K202 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Polr1eQ8K202 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Polr1eQ8K202 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Polr1eQ8K202 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Polr1eQ8K202 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Polr1eQ8K202 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Polr1eQ8K202 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Polr1eQ8K202 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Polr1eQ8K202 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Polr1eQ8K202 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Polr1eQ8K202 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Polr1eQ8K202 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Polr1eQ8K202 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Polr1eQ8K202 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Polr1eQ8K202 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Polr1eQ8K202 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Polr1eQ8K202 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Polr1eQ8K202 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Polr1eQ8K202 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Polr1eQ8K202 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Polr1eQ8K202 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Polr1eQ8K202 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Polr1eQ8K202 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Polr1eQ8K202 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Polr1eQ8K202 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Polr1eQ8K202 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Polr1eQ8K202 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Polr1eQ8K202 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Polr1eQ8K202 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Polr1eQ8K202 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Polr1eQ8K202 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Polr1eQ8K202 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Polr1eQ8K202 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Polr1eQ8K202 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Polr1eQ8K202 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Polr1eQ8K202 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Polr1eQ8K202 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Polr1eQ8K202 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Polr1eQ8K202 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Polr1eQ8K202 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Polr1eQ8K202 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Polr1eQ8K202 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Polr1eQ8K202 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Polr1eQ8K202 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Polr1eQ8K202 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Polr1eQ8K202 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Polr1eQ8K202 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Polr1eQ8K202 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Polr1eQ8K202 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Polr1eQ8K202 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Polr1eQ8K202 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Polr1eQ8K202 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Polr1eQ8K202 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Polr1eQ8K202 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Polr1eQ8K202 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Polr1eQ8K202 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Polr1eQ8K202 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Polr1eQ8K202 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Polr1eQ8K202 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Polr1eQ8K202 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Polr1eQ8K202 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms