Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sde2Q8K1J5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Sde2Q8K1J5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sde2Q8K1J5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sde2Q8K1J5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Sde2Q8K1J5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Sde2Q8K1J5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sde2Q8K1J5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sde2Q8K1J5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sde2Q8K1J5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sde2Q8K1J5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Sde2Q8K1J5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sde2Q8K1J5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sde2Q8K1J5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sde2Q8K1J5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sde2Q8K1J5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sde2Q8K1J5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Sde2Q8K1J5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sde2Q8K1J5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sde2Q8K1J5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sde2Q8K1J5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sde2Q8K1J5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sde2Q8K1J5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sde2Q8K1J5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sde2Q8K1J5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sde2Q8K1J5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sde2Q8K1J5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sde2Q8K1J5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sde2Q8K1J5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Sde2Q8K1J5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sde2Q8K1J5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sde2Q8K1J5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sde2Q8K1J5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sde2Q8K1J5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sde2Q8K1J5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sde2Q8K1J5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sde2Q8K1J5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sde2Q8K1J5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sde2Q8K1J5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sde2Q8K1J5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sde2Q8K1J5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sde2Q8K1J5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sde2Q8K1J5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sde2Q8K1J5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sde2Q8K1J5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sde2Q8K1J5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sde2Q8K1J5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sde2Q8K1J5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sde2Q8K1J5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sde2Q8K1J5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sde2Q8K1J5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sde2Q8K1J5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sde2Q8K1J5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Sde2Q8K1J5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Sde2Q8K1J5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sde2Q8K1J5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sde2Q8K1J5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sde2Q8K1J5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Sde2Q8K1J5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Sde2Q8K1J5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Sde2Q8K1J5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Sde2Q8K1J5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Sde2Q8K1J5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sde2Q8K1J5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sde2Q8K1J5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sde2Q8K1J5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sde2Q8K1J5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sde2Q8K1J5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sde2Q8K1J5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sde2Q8K1J5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sde2Q8K1J5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sde2Q8K1J5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sde2Q8K1J5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sde2Q8K1J5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sde2Q8K1J5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Sde2Q8K1J5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sde2Q8K1J5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sde2Q8K1J5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sde2Q8K1J5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sde2Q8K1J5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sde2Q8K1J5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sde2Q8K1J5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sde2Q8K1J5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sde2Q8K1J5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sde2Q8K1J5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sde2Q8K1J5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sde2Q8K1J5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sde2Q8K1J5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sde2Q8K1J5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sde2Q8K1J5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sde2Q8K1J5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sde2Q8K1J5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sde2Q8K1J5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sde2Q8K1J5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sde2Q8K1J5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sde2Q8K1J5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sde2Q8K1J5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sde2Q8K1J5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sde2Q8K1J5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sde2Q8K1J5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms