Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1C9

Lrrc41, Leucine-rich repeat-containing protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc41Q8K1C9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrc41Q8K1C9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrc41Q8K1C9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrc41Q8K1C9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrc41Q8K1C9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrc41Q8K1C9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrc41Q8K1C9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrc41Q8K1C9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrrc41Q8K1C9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrrc41Q8K1C9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrc41Q8K1C9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrc41Q8K1C9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrc41Q8K1C9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrc41Q8K1C9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrc41Q8K1C9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrc41Q8K1C9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrrc41Q8K1C9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrrc41Q8K1C9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrrc41Q8K1C9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrrc41Q8K1C9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrrc41Q8K1C9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrrc41Q8K1C9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrrc41Q8K1C9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrrc41Q8K1C9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrrc41Q8K1C9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrrc41Q8K1C9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrc41Q8K1C9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrc41Q8K1C9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrc41Q8K1C9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrrc41Q8K1C9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrrc41Q8K1C9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrrc41Q8K1C9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrc41Q8K1C9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrc41Q8K1C9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrrc41Q8K1C9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrrc41Q8K1C9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrrc41Q8K1C9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrrc41Q8K1C9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrrc41Q8K1C9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrrc41Q8K1C9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrrc41Q8K1C9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrrc41Q8K1C9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrrc41Q8K1C9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrrc41Q8K1C9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrrc41Q8K1C9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrrc41Q8K1C9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrrc41Q8K1C9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrrc41Q8K1C9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrrc41Q8K1C9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrrc41Q8K1C9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrrc41Q8K1C9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrrc41Q8K1C9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrrc41Q8K1C9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrrc41Q8K1C9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrrc41Q8K1C9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrrc41Q8K1C9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrrc41Q8K1C9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrrc41Q8K1C9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrrc41Q8K1C9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrc41Q8K1C9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrc41Q8K1C9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrc41Q8K1C9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrrc41Q8K1C9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrrc41Q8K1C9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrrc41Q8K1C9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrrc41Q8K1C9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrrc41Q8K1C9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrrc41Q8K1C9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrrc41Q8K1C9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrrc41Q8K1C9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrrc41Q8K1C9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrrc41Q8K1C9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrrc41Q8K1C9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrrc41Q8K1C9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrrc41Q8K1C9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrrc41Q8K1C9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrrc41Q8K1C9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrrc41Q8K1C9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrrc41Q8K1C9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrrc41Q8K1C9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrrc41Q8K1C9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrrc41Q8K1C9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrrc41Q8K1C9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrrc41Q8K1C9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrrc41Q8K1C9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrc41Q8K1C9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrc41Q8K1C9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrc41Q8K1C9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrc41Q8K1C9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrc41Q8K1C9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrc41Q8K1C9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrrc41Q8K1C9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrrc41Q8K1C9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrrc41Q8K1C9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrrc41Q8K1C9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrrc41Q8K1C9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrrc41Q8K1C9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lrrc41Q8K1C9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Lrrc41Q8K1C9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Lrrc41Q8K1C9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms