Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn34c1Q8K193 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn34c1Q8K193 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn34c1Q8K193 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn34c1Q8K193 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn34c1Q8K193 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn34c1Q8K193 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn34c1Q8K193 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn34c1Q8K193 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn34c1Q8K193 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn34c1Q8K193 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn34c1Q8K193 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn34c1Q8K193 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn34c1Q8K193 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn34c1Q8K193 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn34c1Q8K193 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cldn34c1Q8K193 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cldn34c1Q8K193 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn34c1Q8K193 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn34c1Q8K193 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn34c1Q8K193 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn34c1Q8K193 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn34c1Q8K193 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn34c1Q8K193 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn34c1Q8K193 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn34c1Q8K193 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn34c1Q8K193 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn34c1Q8K193 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn34c1Q8K193 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn34c1Q8K193 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn34c1Q8K193 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn34c1Q8K193 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn34c1Q8K193 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn34c1Q8K193 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn34c1Q8K193 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn34c1Q8K193 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn34c1Q8K193 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn34c1Q8K193 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn34c1Q8K193 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn34c1Q8K193 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn34c1Q8K193 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn34c1Q8K193 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn34c1Q8K193 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn34c1Q8K193 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn34c1Q8K193 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cldn34c1Q8K193 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cldn34c1Q8K193 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn34c1Q8K193 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn34c1Q8K193 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn34c1Q8K193 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn34c1Q8K193 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn34c1Q8K193 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn34c1Q8K193 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn34c1Q8K193 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn34c1Q8K193 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn34c1Q8K193 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn34c1Q8K193 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn34c1Q8K193 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn34c1Q8K193 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn34c1Q8K193 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn34c1Q8K193 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn34c1Q8K193 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn34c1Q8K193 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn34c1Q8K193 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn34c1Q8K193 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn34c1Q8K193 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn34c1Q8K193 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn34c1Q8K193 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn34c1Q8K193 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn34c1Q8K193 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn34c1Q8K193 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn34c1Q8K193 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn34c1Q8K193 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn34c1Q8K193 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn34c1Q8K193 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn34c1Q8K193 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn34c1Q8K193 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn34c1Q8K193 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn34c1Q8K193 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn34c1Q8K193 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn34c1Q8K193 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn34c1Q8K193 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn34c1Q8K193 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn34c1Q8K193 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn34c1Q8K193 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cldn34c1Q8K193 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cldn34c1Q8K193 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn34c1Q8K193 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn34c1Q8K193 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn34c1Q8K193 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn34c1Q8K193 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn34c1Q8K193 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn34c1Q8K193 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn34c1Q8K193 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn34c1Q8K193 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn34c1Q8K193 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn34c1Q8K193 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn34c1Q8K193 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn34c1Q8K193 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn34c1Q8K193 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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