Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LgsnQ8CIX8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LgsnQ8CIX8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LgsnQ8CIX8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LgsnQ8CIX8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LgsnQ8CIX8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LgsnQ8CIX8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LgsnQ8CIX8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LgsnQ8CIX8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LgsnQ8CIX8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LgsnQ8CIX8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LgsnQ8CIX8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LgsnQ8CIX8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LgsnQ8CIX8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LgsnQ8CIX8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LgsnQ8CIX8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LgsnQ8CIX8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LgsnQ8CIX8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LgsnQ8CIX8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LgsnQ8CIX8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LgsnQ8CIX8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LgsnQ8CIX8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LgsnQ8CIX8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LgsnQ8CIX8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LgsnQ8CIX8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LgsnQ8CIX8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LgsnQ8CIX8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LgsnQ8CIX8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LgsnQ8CIX8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LgsnQ8CIX8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LgsnQ8CIX8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LgsnQ8CIX8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LgsnQ8CIX8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LgsnQ8CIX8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LgsnQ8CIX8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LgsnQ8CIX8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LgsnQ8CIX8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LgsnQ8CIX8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LgsnQ8CIX8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LgsnQ8CIX8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LgsnQ8CIX8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LgsnQ8CIX8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LgsnQ8CIX8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LgsnQ8CIX8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LgsnQ8CIX8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LgsnQ8CIX8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LgsnQ8CIX8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LgsnQ8CIX8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LgsnQ8CIX8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LgsnQ8CIX8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LgsnQ8CIX8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LgsnQ8CIX8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LgsnQ8CIX8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LgsnQ8CIX8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LgsnQ8CIX8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LgsnQ8CIX8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LgsnQ8CIX8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LgsnQ8CIX8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LgsnQ8CIX8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LgsnQ8CIX8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LgsnQ8CIX8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LgsnQ8CIX8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LgsnQ8CIX8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LgsnQ8CIX8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LgsnQ8CIX8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LgsnQ8CIX8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LgsnQ8CIX8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
LgsnQ8CIX8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LgsnQ8CIX8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LgsnQ8CIX8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LgsnQ8CIX8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LgsnQ8CIX8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LgsnQ8CIX8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LgsnQ8CIX8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LgsnQ8CIX8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LgsnQ8CIX8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LgsnQ8CIX8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LgsnQ8CIX8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LgsnQ8CIX8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LgsnQ8CIX8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LgsnQ8CIX8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LgsnQ8CIX8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LgsnQ8CIX8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LgsnQ8CIX8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LgsnQ8CIX8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LgsnQ8CIX8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LgsnQ8CIX8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LgsnQ8CIX8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LgsnQ8CIX8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LgsnQ8CIX8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LgsnQ8CIX8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LgsnQ8CIX8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LgsnQ8CIX8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LgsnQ8CIX8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LgsnQ8CIX8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LgsnQ8CIX8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LgsnQ8CIX8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LgsnQ8CIX8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LgsnQ8CIX8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LgsnQ8CIX8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms