Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI96

Clip4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip4Q8CI96 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clip4Q8CI96 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clip4Q8CI96 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clip4Q8CI96 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clip4Q8CI96 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clip4Q8CI96 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clip4Q8CI96 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Clip4Q8CI96 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clip4Q8CI96 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clip4Q8CI96 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clip4Q8CI96 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clip4Q8CI96 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clip4Q8CI96 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clip4Q8CI96 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clip4Q8CI96 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clip4Q8CI96 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Clip4Q8CI96 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Clip4Q8CI96 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Clip4Q8CI96 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Clip4Q8CI96 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Clip4Q8CI96 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clip4Q8CI96 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clip4Q8CI96 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clip4Q8CI96 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clip4Q8CI96 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clip4Q8CI96 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clip4Q8CI96 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clip4Q8CI96 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clip4Q8CI96 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clip4Q8CI96 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clip4Q8CI96 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clip4Q8CI96 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clip4Q8CI96 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clip4Q8CI96 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clip4Q8CI96 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clip4Q8CI96 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clip4Q8CI96 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clip4Q8CI96 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clip4Q8CI96 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clip4Q8CI96 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clip4Q8CI96 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clip4Q8CI96 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clip4Q8CI96 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Clip4Q8CI96 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clip4Q8CI96 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clip4Q8CI96 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clip4Q8CI96 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clip4Q8CI96 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clip4Q8CI96 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clip4Q8CI96 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clip4Q8CI96 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clip4Q8CI96 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clip4Q8CI96 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clip4Q8CI96 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clip4Q8CI96 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clip4Q8CI96 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clip4Q8CI96 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Clip4Q8CI96 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clip4Q8CI96 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clip4Q8CI96 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clip4Q8CI96 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clip4Q8CI96 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clip4Q8CI96 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clip4Q8CI96 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clip4Q8CI96 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clip4Q8CI96 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clip4Q8CI96 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clip4Q8CI96 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clip4Q8CI96 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clip4Q8CI96 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clip4Q8CI96 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clip4Q8CI96 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clip4Q8CI96 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clip4Q8CI96 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clip4Q8CI96 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clip4Q8CI96 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clip4Q8CI96 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clip4Q8CI96 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clip4Q8CI96 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clip4Q8CI96 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clip4Q8CI96 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clip4Q8CI96 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clip4Q8CI96 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clip4Q8CI96 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clip4Q8CI96 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clip4Q8CI96 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clip4Q8CI96 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clip4Q8CI96 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clip4Q8CI96 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clip4Q8CI96 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clip4Q8CI96 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clip4Q8CI96 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clip4Q8CI96 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clip4Q8CI96 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clip4Q8CI96 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clip4Q8CI96 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clip4Q8CI96 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clip4Q8CI96 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clip4Q8CI96 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clip4Q8CI96 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms