Protein–RNA interactions for Protein: Q8CG16

C1ra, Complement C1r-A subcomponent, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1raQ8CG16 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1raQ8CG16 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1raQ8CG16 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1raQ8CG16 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1raQ8CG16 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1raQ8CG16 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1raQ8CG16 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1raQ8CG16 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1raQ8CG16 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1raQ8CG16 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1raQ8CG16 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1raQ8CG16 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1raQ8CG16 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1raQ8CG16 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1raQ8CG16 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
C1raQ8CG16 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1raQ8CG16 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1raQ8CG16 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1raQ8CG16 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1raQ8CG16 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1raQ8CG16 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
C1raQ8CG16 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1raQ8CG16 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1raQ8CG16 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1raQ8CG16 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1raQ8CG16 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1raQ8CG16 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1raQ8CG16 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1raQ8CG16 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1raQ8CG16 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1raQ8CG16 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
C1raQ8CG16 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1raQ8CG16 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
C1raQ8CG16 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1raQ8CG16 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1raQ8CG16 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1raQ8CG16 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1raQ8CG16 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1raQ8CG16 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1raQ8CG16 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1raQ8CG16 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1raQ8CG16 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1raQ8CG16 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
C1raQ8CG16 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1raQ8CG16 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1raQ8CG16 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1raQ8CG16 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1raQ8CG16 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1raQ8CG16 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1raQ8CG16 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1raQ8CG16 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
C1raQ8CG16 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1raQ8CG16 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1raQ8CG16 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1raQ8CG16 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1raQ8CG16 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1raQ8CG16 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1raQ8CG16 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1raQ8CG16 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1raQ8CG16 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1raQ8CG16 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1raQ8CG16 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1raQ8CG16 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1raQ8CG16 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1raQ8CG16 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C1raQ8CG16 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1raQ8CG16 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1raQ8CG16 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1raQ8CG16 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1raQ8CG16 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1raQ8CG16 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1raQ8CG16 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1raQ8CG16 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1raQ8CG16 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1raQ8CG16 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1raQ8CG16 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1raQ8CG16 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1raQ8CG16 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1raQ8CG16 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1raQ8CG16 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1raQ8CG16 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1raQ8CG16 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1raQ8CG16 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1raQ8CG16 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1raQ8CG16 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1raQ8CG16 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1raQ8CG16 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1raQ8CG16 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1raQ8CG16 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1raQ8CG16 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1raQ8CG16 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1raQ8CG16 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C1raQ8CG16 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C1raQ8CG16 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1raQ8CG16 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1raQ8CG16 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1raQ8CG16 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1raQ8CG16 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1raQ8CG16 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1raQ8CG16 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.3 ms