Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
Setd1bQ8CFT2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Setd1bQ8CFT2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Setd1bQ8CFT2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Setd1bQ8CFT2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Setd1bQ8CFT2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Setd1bQ8CFT2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.63
Setd1bQ8CFT2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.63
Setd1bQ8CFT2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
Setd1bQ8CFT2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Setd1bQ8CFT2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Setd1bQ8CFT2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Setd1bQ8CFT2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Setd1bQ8CFT2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
Setd1bQ8CFT2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Setd1bQ8CFT2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
Setd1bQ8CFT2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Setd1bQ8CFT2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Setd1bQ8CFT2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
Setd1bQ8CFT2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Setd1bQ8CFT2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Setd1bQ8CFT2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
Setd1bQ8CFT2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Setd1bQ8CFT2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
Setd1bQ8CFT2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
Setd1bQ8CFT2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Setd1bQ8CFT2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.67■■■■□ 3.62
Setd1bQ8CFT2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC37.67■■■■□ 3.62
Setd1bQ8CFT2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC37.66■■■■□ 3.62
Setd1bQ8CFT2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Setd1bQ8CFT2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Setd1bQ8CFT2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Setd1bQ8CFT2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Setd1bQ8CFT2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Setd1bQ8CFT2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Setd1bQ8CFT2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
Setd1bQ8CFT2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
Setd1bQ8CFT2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
Setd1bQ8CFT2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
Setd1bQ8CFT2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC37.61■■■■□ 3.61
Setd1bQ8CFT2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Setd1bQ8CFT2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
Setd1bQ8CFT2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Setd1bQ8CFT2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Setd1bQ8CFT2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC37.59■■■■□ 3.61
Setd1bQ8CFT2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Setd1bQ8CFT2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
Setd1bQ8CFT2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Setd1bQ8CFT2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
Setd1bQ8CFT2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Setd1bQ8CFT2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Setd1bQ8CFT2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Setd1bQ8CFT2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
Setd1bQ8CFT2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
Setd1bQ8CFT2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Setd1bQ8CFT2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Setd1bQ8CFT2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
Setd1bQ8CFT2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Setd1bQ8CFT2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Setd1bQ8CFT2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC37.52■■■■□ 3.6
Setd1bQ8CFT2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Setd1bQ8CFT2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Setd1bQ8CFT2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC37.51■■■■□ 3.6
Setd1bQ8CFT2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
Setd1bQ8CFT2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Setd1bQ8CFT2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Setd1bQ8CFT2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Setd1bQ8CFT2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
Setd1bQ8CFT2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
Setd1bQ8CFT2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
Setd1bQ8CFT2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
Setd1bQ8CFT2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
Setd1bQ8CFT2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Setd1bQ8CFT2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Setd1bQ8CFT2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
Setd1bQ8CFT2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Setd1bQ8CFT2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Setd1bQ8CFT2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Setd1bQ8CFT2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Setd1bQ8CFT2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Setd1bQ8CFT2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
Setd1bQ8CFT2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
Setd1bQ8CFT2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Setd1bQ8CFT2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Setd1bQ8CFT2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
Setd1bQ8CFT2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Setd1bQ8CFT2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC37.39■■■■□ 3.58
Setd1bQ8CFT2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
Setd1bQ8CFT2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Setd1bQ8CFT2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Setd1bQ8CFT2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Setd1bQ8CFT2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Setd1bQ8CFT2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Setd1bQ8CFT2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Setd1bQ8CFT2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Setd1bQ8CFT2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Setd1bQ8CFT2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Setd1bQ8CFT2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
Setd1bQ8CFT2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Setd1bQ8CFT2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.9 ms