Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFH6

Sik2, Serine/threonine-protein kinase SIK2, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik2Q8CFH6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sik2Q8CFH6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sik2Q8CFH6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sik2Q8CFH6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sik2Q8CFH6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sik2Q8CFH6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sik2Q8CFH6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sik2Q8CFH6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sik2Q8CFH6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sik2Q8CFH6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sik2Q8CFH6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sik2Q8CFH6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sik2Q8CFH6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sik2Q8CFH6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sik2Q8CFH6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sik2Q8CFH6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sik2Q8CFH6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sik2Q8CFH6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sik2Q8CFH6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sik2Q8CFH6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sik2Q8CFH6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sik2Q8CFH6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Sik2Q8CFH6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sik2Q8CFH6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sik2Q8CFH6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sik2Q8CFH6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sik2Q8CFH6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sik2Q8CFH6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sik2Q8CFH6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sik2Q8CFH6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sik2Q8CFH6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sik2Q8CFH6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sik2Q8CFH6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sik2Q8CFH6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sik2Q8CFH6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sik2Q8CFH6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sik2Q8CFH6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Sik2Q8CFH6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sik2Q8CFH6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sik2Q8CFH6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sik2Q8CFH6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sik2Q8CFH6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sik2Q8CFH6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sik2Q8CFH6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sik2Q8CFH6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sik2Q8CFH6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sik2Q8CFH6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sik2Q8CFH6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sik2Q8CFH6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sik2Q8CFH6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sik2Q8CFH6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Sik2Q8CFH6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sik2Q8CFH6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sik2Q8CFH6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sik2Q8CFH6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sik2Q8CFH6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sik2Q8CFH6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sik2Q8CFH6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sik2Q8CFH6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sik2Q8CFH6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Sik2Q8CFH6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sik2Q8CFH6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sik2Q8CFH6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sik2Q8CFH6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sik2Q8CFH6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sik2Q8CFH6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sik2Q8CFH6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sik2Q8CFH6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sik2Q8CFH6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sik2Q8CFH6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sik2Q8CFH6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Sik2Q8CFH6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sik2Q8CFH6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sik2Q8CFH6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sik2Q8CFH6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sik2Q8CFH6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sik2Q8CFH6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sik2Q8CFH6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sik2Q8CFH6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Sik2Q8CFH6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sik2Q8CFH6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sik2Q8CFH6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sik2Q8CFH6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sik2Q8CFH6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sik2Q8CFH6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sik2Q8CFH6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sik2Q8CFH6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sik2Q8CFH6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sik2Q8CFH6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sik2Q8CFH6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sik2Q8CFH6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sik2Q8CFH6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sik2Q8CFH6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sik2Q8CFH6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sik2Q8CFH6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sik2Q8CFH6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sik2Q8CFH6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sik2Q8CFH6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Sik2Q8CFH6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Sik2Q8CFH6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms