Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

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Length 102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm9955Q8CEJ8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm9955Q8CEJ8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm9955Q8CEJ8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm9955Q8CEJ8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm9955Q8CEJ8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm9955Q8CEJ8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm9955Q8CEJ8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm9955Q8CEJ8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm9955Q8CEJ8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm9955Q8CEJ8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm9955Q8CEJ8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm9955Q8CEJ8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm9955Q8CEJ8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm9955Q8CEJ8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm9955Q8CEJ8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm9955Q8CEJ8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm9955Q8CEJ8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm9955Q8CEJ8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm9955Q8CEJ8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm9955Q8CEJ8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm9955Q8CEJ8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm9955Q8CEJ8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm9955Q8CEJ8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm9955Q8CEJ8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm9955Q8CEJ8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm9955Q8CEJ8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm9955Q8CEJ8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm9955Q8CEJ8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm9955Q8CEJ8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm9955Q8CEJ8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm9955Q8CEJ8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm9955Q8CEJ8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm9955Q8CEJ8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm9955Q8CEJ8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm9955Q8CEJ8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm9955Q8CEJ8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm9955Q8CEJ8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm9955Q8CEJ8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm9955Q8CEJ8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm9955Q8CEJ8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm9955Q8CEJ8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm9955Q8CEJ8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm9955Q8CEJ8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm9955Q8CEJ8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm9955Q8CEJ8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm9955Q8CEJ8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm9955Q8CEJ8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm9955Q8CEJ8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm9955Q8CEJ8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm9955Q8CEJ8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm9955Q8CEJ8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm9955Q8CEJ8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm9955Q8CEJ8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm9955Q8CEJ8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm9955Q8CEJ8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm9955Q8CEJ8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm9955Q8CEJ8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm9955Q8CEJ8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm9955Q8CEJ8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm9955Q8CEJ8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm9955Q8CEJ8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm9955Q8CEJ8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm9955Q8CEJ8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm9955Q8CEJ8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm9955Q8CEJ8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm9955Q8CEJ8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm9955Q8CEJ8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm9955Q8CEJ8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm9955Q8CEJ8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm9955Q8CEJ8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm9955Q8CEJ8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm9955Q8CEJ8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm9955Q8CEJ8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm9955Q8CEJ8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm9955Q8CEJ8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm9955Q8CEJ8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm9955Q8CEJ8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm9955Q8CEJ8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm9955Q8CEJ8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm9955Q8CEJ8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm9955Q8CEJ8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm9955Q8CEJ8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm9955Q8CEJ8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm9955Q8CEJ8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm9955Q8CEJ8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm9955Q8CEJ8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm9955Q8CEJ8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm9955Q8CEJ8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm9955Q8CEJ8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm9955Q8CEJ8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm9955Q8CEJ8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm9955Q8CEJ8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm9955Q8CEJ8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm9955Q8CEJ8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm9955Q8CEJ8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm9955Q8CEJ8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm9955Q8CEJ8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm9955Q8CEJ8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm9955Q8CEJ8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
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