Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc38Q8CDN8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc38Q8CDN8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc38Q8CDN8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc38Q8CDN8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc38Q8CDN8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc38Q8CDN8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc38Q8CDN8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc38Q8CDN8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc38Q8CDN8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc38Q8CDN8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc38Q8CDN8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc38Q8CDN8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc38Q8CDN8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc38Q8CDN8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc38Q8CDN8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc38Q8CDN8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc38Q8CDN8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc38Q8CDN8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc38Q8CDN8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc38Q8CDN8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc38Q8CDN8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc38Q8CDN8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc38Q8CDN8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc38Q8CDN8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc38Q8CDN8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc38Q8CDN8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc38Q8CDN8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc38Q8CDN8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc38Q8CDN8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc38Q8CDN8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc38Q8CDN8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc38Q8CDN8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc38Q8CDN8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc38Q8CDN8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc38Q8CDN8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc38Q8CDN8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc38Q8CDN8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc38Q8CDN8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc38Q8CDN8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc38Q8CDN8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc38Q8CDN8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc38Q8CDN8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc38Q8CDN8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc38Q8CDN8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc38Q8CDN8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc38Q8CDN8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc38Q8CDN8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc38Q8CDN8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc38Q8CDN8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc38Q8CDN8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc38Q8CDN8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc38Q8CDN8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc38Q8CDN8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc38Q8CDN8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc38Q8CDN8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc38Q8CDN8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc38Q8CDN8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc38Q8CDN8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc38Q8CDN8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc38Q8CDN8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc38Q8CDN8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc38Q8CDN8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc38Q8CDN8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc38Q8CDN8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc38Q8CDN8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc38Q8CDN8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc38Q8CDN8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc38Q8CDN8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc38Q8CDN8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc38Q8CDN8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc38Q8CDN8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc38Q8CDN8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc38Q8CDN8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc38Q8CDN8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc38Q8CDN8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc38Q8CDN8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc38Q8CDN8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc38Q8CDN8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc38Q8CDN8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc38Q8CDN8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc38Q8CDN8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc38Q8CDN8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc38Q8CDN8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc38Q8CDN8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc38Q8CDN8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc38Q8CDN8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc38Q8CDN8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc38Q8CDN8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc38Q8CDN8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc38Q8CDN8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc38Q8CDN8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc38Q8CDN8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc38Q8CDN8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc38Q8CDN8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc38Q8CDN8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc38Q8CDN8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc38Q8CDN8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc38Q8CDN8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc38Q8CDN8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms