Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RybpQ8CCI5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RybpQ8CCI5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RybpQ8CCI5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RybpQ8CCI5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RybpQ8CCI5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RybpQ8CCI5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RybpQ8CCI5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RybpQ8CCI5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RybpQ8CCI5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RybpQ8CCI5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RybpQ8CCI5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RybpQ8CCI5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RybpQ8CCI5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RybpQ8CCI5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RybpQ8CCI5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
RybpQ8CCI5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RybpQ8CCI5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RybpQ8CCI5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RybpQ8CCI5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RybpQ8CCI5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RybpQ8CCI5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RybpQ8CCI5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RybpQ8CCI5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RybpQ8CCI5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RybpQ8CCI5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RybpQ8CCI5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RybpQ8CCI5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RybpQ8CCI5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RybpQ8CCI5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RybpQ8CCI5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RybpQ8CCI5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RybpQ8CCI5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RybpQ8CCI5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RybpQ8CCI5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RybpQ8CCI5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RybpQ8CCI5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RybpQ8CCI5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RybpQ8CCI5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RybpQ8CCI5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RybpQ8CCI5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RybpQ8CCI5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RybpQ8CCI5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RybpQ8CCI5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RybpQ8CCI5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RybpQ8CCI5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RybpQ8CCI5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RybpQ8CCI5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RybpQ8CCI5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RybpQ8CCI5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RybpQ8CCI5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RybpQ8CCI5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RybpQ8CCI5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RybpQ8CCI5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RybpQ8CCI5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RybpQ8CCI5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RybpQ8CCI5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RybpQ8CCI5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RybpQ8CCI5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RybpQ8CCI5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RybpQ8CCI5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RybpQ8CCI5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RybpQ8CCI5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RybpQ8CCI5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RybpQ8CCI5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RybpQ8CCI5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RybpQ8CCI5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RybpQ8CCI5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RybpQ8CCI5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RybpQ8CCI5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RybpQ8CCI5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RybpQ8CCI5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RybpQ8CCI5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RybpQ8CCI5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RybpQ8CCI5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RybpQ8CCI5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RybpQ8CCI5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RybpQ8CCI5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RybpQ8CCI5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RybpQ8CCI5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RybpQ8CCI5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RybpQ8CCI5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RybpQ8CCI5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RybpQ8CCI5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RybpQ8CCI5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RybpQ8CCI5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RybpQ8CCI5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RybpQ8CCI5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RybpQ8CCI5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RybpQ8CCI5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RybpQ8CCI5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RybpQ8CCI5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RybpQ8CCI5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RybpQ8CCI5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RybpQ8CCI5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RybpQ8CCI5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RybpQ8CCI5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RybpQ8CCI5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RybpQ8CCI5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RybpQ8CCI5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
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