Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nhlrc3Q8CCH2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nhlrc3Q8CCH2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nhlrc3Q8CCH2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nhlrc3Q8CCH2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nhlrc3Q8CCH2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nhlrc3Q8CCH2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nhlrc3Q8CCH2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nhlrc3Q8CCH2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms