Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBQ5

Pi4k2b, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pi4k2bQ8CBQ5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pi4k2bQ8CBQ5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pi4k2bQ8CBQ5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pi4k2bQ8CBQ5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pi4k2bQ8CBQ5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pi4k2bQ8CBQ5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pi4k2bQ8CBQ5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pi4k2bQ8CBQ5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pi4k2bQ8CBQ5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pi4k2bQ8CBQ5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pi4k2bQ8CBQ5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pi4k2bQ8CBQ5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pi4k2bQ8CBQ5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pi4k2bQ8CBQ5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pi4k2bQ8CBQ5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pi4k2bQ8CBQ5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pi4k2bQ8CBQ5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pi4k2bQ8CBQ5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pi4k2bQ8CBQ5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pi4k2bQ8CBQ5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pi4k2bQ8CBQ5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pi4k2bQ8CBQ5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pi4k2bQ8CBQ5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pi4k2bQ8CBQ5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pi4k2bQ8CBQ5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pi4k2bQ8CBQ5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pi4k2bQ8CBQ5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pi4k2bQ8CBQ5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pi4k2bQ8CBQ5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pi4k2bQ8CBQ5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pi4k2bQ8CBQ5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pi4k2bQ8CBQ5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pi4k2bQ8CBQ5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pi4k2bQ8CBQ5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pi4k2bQ8CBQ5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pi4k2bQ8CBQ5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pi4k2bQ8CBQ5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pi4k2bQ8CBQ5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pi4k2bQ8CBQ5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pi4k2bQ8CBQ5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pi4k2bQ8CBQ5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pi4k2bQ8CBQ5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pi4k2bQ8CBQ5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pi4k2bQ8CBQ5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pi4k2bQ8CBQ5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pi4k2bQ8CBQ5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Pi4k2bQ8CBQ5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pi4k2bQ8CBQ5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pi4k2bQ8CBQ5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pi4k2bQ8CBQ5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pi4k2bQ8CBQ5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pi4k2bQ8CBQ5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pi4k2bQ8CBQ5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pi4k2bQ8CBQ5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pi4k2bQ8CBQ5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pi4k2bQ8CBQ5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pi4k2bQ8CBQ5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pi4k2bQ8CBQ5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pi4k2bQ8CBQ5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pi4k2bQ8CBQ5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pi4k2bQ8CBQ5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pi4k2bQ8CBQ5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pi4k2bQ8CBQ5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pi4k2bQ8CBQ5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pi4k2bQ8CBQ5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pi4k2bQ8CBQ5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pi4k2bQ8CBQ5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pi4k2bQ8CBQ5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pi4k2bQ8CBQ5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pi4k2bQ8CBQ5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pi4k2bQ8CBQ5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pi4k2bQ8CBQ5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pi4k2bQ8CBQ5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pi4k2bQ8CBQ5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pi4k2bQ8CBQ5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pi4k2bQ8CBQ5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pi4k2bQ8CBQ5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pi4k2bQ8CBQ5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pi4k2bQ8CBQ5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pi4k2bQ8CBQ5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pi4k2bQ8CBQ5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pi4k2bQ8CBQ5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pi4k2bQ8CBQ5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pi4k2bQ8CBQ5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pi4k2bQ8CBQ5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pi4k2bQ8CBQ5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Pi4k2bQ8CBQ5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pi4k2bQ8CBQ5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pi4k2bQ8CBQ5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Pi4k2bQ8CBQ5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pi4k2bQ8CBQ5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pi4k2bQ8CBQ5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Pi4k2bQ8CBQ5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pi4k2bQ8CBQ5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pi4k2bQ8CBQ5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pi4k2bQ8CBQ5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pi4k2bQ8CBQ5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pi4k2bQ8CBQ5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Pi4k2bQ8CBQ5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pi4k2bQ8CBQ5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.7 ms