Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAE9

Podxl2, Podocalyxin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podxl2Q8CAE9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Podxl2Q8CAE9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Podxl2Q8CAE9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Podxl2Q8CAE9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Podxl2Q8CAE9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Podxl2Q8CAE9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Podxl2Q8CAE9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Podxl2Q8CAE9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Podxl2Q8CAE9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Podxl2Q8CAE9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Podxl2Q8CAE9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Podxl2Q8CAE9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Podxl2Q8CAE9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Podxl2Q8CAE9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Podxl2Q8CAE9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Podxl2Q8CAE9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Podxl2Q8CAE9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Podxl2Q8CAE9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Podxl2Q8CAE9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Podxl2Q8CAE9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Podxl2Q8CAE9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Podxl2Q8CAE9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Podxl2Q8CAE9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Podxl2Q8CAE9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Podxl2Q8CAE9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Podxl2Q8CAE9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Podxl2Q8CAE9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Podxl2Q8CAE9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Podxl2Q8CAE9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Podxl2Q8CAE9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Podxl2Q8CAE9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Podxl2Q8CAE9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Podxl2Q8CAE9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Podxl2Q8CAE9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Podxl2Q8CAE9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Podxl2Q8CAE9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Podxl2Q8CAE9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Podxl2Q8CAE9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Podxl2Q8CAE9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Podxl2Q8CAE9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Podxl2Q8CAE9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Podxl2Q8CAE9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Podxl2Q8CAE9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Podxl2Q8CAE9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Podxl2Q8CAE9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Podxl2Q8CAE9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Podxl2Q8CAE9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Podxl2Q8CAE9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Podxl2Q8CAE9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Podxl2Q8CAE9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Podxl2Q8CAE9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Podxl2Q8CAE9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Podxl2Q8CAE9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Podxl2Q8CAE9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Podxl2Q8CAE9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Podxl2Q8CAE9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Podxl2Q8CAE9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Podxl2Q8CAE9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Podxl2Q8CAE9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Podxl2Q8CAE9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Podxl2Q8CAE9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Podxl2Q8CAE9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Podxl2Q8CAE9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Podxl2Q8CAE9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Podxl2Q8CAE9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Podxl2Q8CAE9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Podxl2Q8CAE9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Podxl2Q8CAE9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Podxl2Q8CAE9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Podxl2Q8CAE9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Podxl2Q8CAE9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Podxl2Q8CAE9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Podxl2Q8CAE9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Podxl2Q8CAE9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Podxl2Q8CAE9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Podxl2Q8CAE9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Podxl2Q8CAE9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Podxl2Q8CAE9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Podxl2Q8CAE9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Podxl2Q8CAE9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Podxl2Q8CAE9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Podxl2Q8CAE9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Podxl2Q8CAE9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Podxl2Q8CAE9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Podxl2Q8CAE9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Podxl2Q8CAE9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Podxl2Q8CAE9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Podxl2Q8CAE9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Podxl2Q8CAE9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Podxl2Q8CAE9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Podxl2Q8CAE9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Podxl2Q8CAE9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Podxl2Q8CAE9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Podxl2Q8CAE9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Podxl2Q8CAE9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Podxl2Q8CAE9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Podxl2Q8CAE9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Podxl2Q8CAE9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Podxl2Q8CAE9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Podxl2Q8CAE9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms