Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9X1

Sntn, Sentan, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SntnQ8C9X1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SntnQ8C9X1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SntnQ8C9X1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SntnQ8C9X1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SntnQ8C9X1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SntnQ8C9X1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SntnQ8C9X1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SntnQ8C9X1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SntnQ8C9X1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SntnQ8C9X1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SntnQ8C9X1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SntnQ8C9X1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SntnQ8C9X1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SntnQ8C9X1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SntnQ8C9X1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SntnQ8C9X1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SntnQ8C9X1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SntnQ8C9X1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SntnQ8C9X1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SntnQ8C9X1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SntnQ8C9X1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SntnQ8C9X1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SntnQ8C9X1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SntnQ8C9X1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SntnQ8C9X1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SntnQ8C9X1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SntnQ8C9X1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SntnQ8C9X1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SntnQ8C9X1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SntnQ8C9X1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SntnQ8C9X1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SntnQ8C9X1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SntnQ8C9X1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SntnQ8C9X1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SntnQ8C9X1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SntnQ8C9X1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SntnQ8C9X1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SntnQ8C9X1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SntnQ8C9X1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SntnQ8C9X1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SntnQ8C9X1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SntnQ8C9X1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SntnQ8C9X1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SntnQ8C9X1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SntnQ8C9X1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SntnQ8C9X1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SntnQ8C9X1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SntnQ8C9X1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SntnQ8C9X1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SntnQ8C9X1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SntnQ8C9X1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SntnQ8C9X1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SntnQ8C9X1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SntnQ8C9X1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SntnQ8C9X1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SntnQ8C9X1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SntnQ8C9X1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SntnQ8C9X1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SntnQ8C9X1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SntnQ8C9X1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SntnQ8C9X1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SntnQ8C9X1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SntnQ8C9X1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SntnQ8C9X1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SntnQ8C9X1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SntnQ8C9X1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SntnQ8C9X1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SntnQ8C9X1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SntnQ8C9X1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SntnQ8C9X1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SntnQ8C9X1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SntnQ8C9X1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SntnQ8C9X1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SntnQ8C9X1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SntnQ8C9X1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SntnQ8C9X1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SntnQ8C9X1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SntnQ8C9X1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SntnQ8C9X1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SntnQ8C9X1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SntnQ8C9X1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SntnQ8C9X1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SntnQ8C9X1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SntnQ8C9X1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SntnQ8C9X1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SntnQ8C9X1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SntnQ8C9X1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SntnQ8C9X1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SntnQ8C9X1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SntnQ8C9X1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SntnQ8C9X1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SntnQ8C9X1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SntnQ8C9X1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SntnQ8C9X1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SntnQ8C9X1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SntnQ8C9X1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SntnQ8C9X1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SntnQ8C9X1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SntnQ8C9X1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SntnQ8C9X1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms