Protein–RNA interactions for Protein: Q8C735

Lin9, Protein lin-9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin9Q8C735 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lin9Q8C735 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lin9Q8C735 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lin9Q8C735 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lin9Q8C735 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lin9Q8C735 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lin9Q8C735 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lin9Q8C735 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lin9Q8C735 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lin9Q8C735 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lin9Q8C735 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lin9Q8C735 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lin9Q8C735 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lin9Q8C735 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Lin9Q8C735 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lin9Q8C735 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lin9Q8C735 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lin9Q8C735 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lin9Q8C735 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lin9Q8C735 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lin9Q8C735 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lin9Q8C735 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lin9Q8C735 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lin9Q8C735 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lin9Q8C735 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lin9Q8C735 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lin9Q8C735 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lin9Q8C735 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lin9Q8C735 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lin9Q8C735 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lin9Q8C735 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lin9Q8C735 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lin9Q8C735 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lin9Q8C735 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lin9Q8C735 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lin9Q8C735 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lin9Q8C735 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Lin9Q8C735 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lin9Q8C735 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lin9Q8C735 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Lin9Q8C735 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lin9Q8C735 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lin9Q8C735 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lin9Q8C735 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lin9Q8C735 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lin9Q8C735 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lin9Q8C735 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lin9Q8C735 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lin9Q8C735 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lin9Q8C735 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lin9Q8C735 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Lin9Q8C735 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lin9Q8C735 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lin9Q8C735 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lin9Q8C735 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lin9Q8C735 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lin9Q8C735 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lin9Q8C735 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Lin9Q8C735 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lin9Q8C735 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lin9Q8C735 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lin9Q8C735 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lin9Q8C735 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lin9Q8C735 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lin9Q8C735 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lin9Q8C735 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lin9Q8C735 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lin9Q8C735 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lin9Q8C735 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lin9Q8C735 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lin9Q8C735 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lin9Q8C735 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lin9Q8C735 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lin9Q8C735 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lin9Q8C735 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lin9Q8C735 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lin9Q8C735 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lin9Q8C735 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lin9Q8C735 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lin9Q8C735 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lin9Q8C735 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lin9Q8C735 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lin9Q8C735 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lin9Q8C735 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lin9Q8C735 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lin9Q8C735 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lin9Q8C735 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lin9Q8C735 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lin9Q8C735 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lin9Q8C735 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Lin9Q8C735 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lin9Q8C735 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lin9Q8C735 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Lin9Q8C735 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lin9Q8C735 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lin9Q8C735 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lin9Q8C735 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lin9Q8C735 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lin9Q8C735 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lin9Q8C735 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.3 ms