Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6J9

Nlrp4b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4bQ8C6J9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Nlrp4bQ8C6J9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nlrp4bQ8C6J9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nlrp4bQ8C6J9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nlrp4bQ8C6J9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nlrp4bQ8C6J9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nlrp4bQ8C6J9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nlrp4bQ8C6J9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nlrp4bQ8C6J9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nlrp4bQ8C6J9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nlrp4bQ8C6J9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nlrp4bQ8C6J9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nlrp4bQ8C6J9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlrp4bQ8C6J9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlrp4bQ8C6J9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlrp4bQ8C6J9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlrp4bQ8C6J9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlrp4bQ8C6J9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nlrp4bQ8C6J9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nlrp4bQ8C6J9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nlrp4bQ8C6J9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nlrp4bQ8C6J9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nlrp4bQ8C6J9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Nlrp4bQ8C6J9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nlrp4bQ8C6J9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nlrp4bQ8C6J9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nlrp4bQ8C6J9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nlrp4bQ8C6J9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nlrp4bQ8C6J9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nlrp4bQ8C6J9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nlrp4bQ8C6J9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nlrp4bQ8C6J9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nlrp4bQ8C6J9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nlrp4bQ8C6J9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nlrp4bQ8C6J9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nlrp4bQ8C6J9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Nlrp4bQ8C6J9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nlrp4bQ8C6J9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nlrp4bQ8C6J9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nlrp4bQ8C6J9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nlrp4bQ8C6J9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Nlrp4bQ8C6J9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nlrp4bQ8C6J9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Nlrp4bQ8C6J9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nlrp4bQ8C6J9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nlrp4bQ8C6J9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nlrp4bQ8C6J9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nlrp4bQ8C6J9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nlrp4bQ8C6J9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nlrp4bQ8C6J9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nlrp4bQ8C6J9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nlrp4bQ8C6J9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nlrp4bQ8C6J9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Nlrp4bQ8C6J9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nlrp4bQ8C6J9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nlrp4bQ8C6J9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nlrp4bQ8C6J9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nlrp4bQ8C6J9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nlrp4bQ8C6J9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nlrp4bQ8C6J9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nlrp4bQ8C6J9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Nlrp4bQ8C6J9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nlrp4bQ8C6J9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nlrp4bQ8C6J9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nlrp4bQ8C6J9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nlrp4bQ8C6J9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Nlrp4bQ8C6J9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nlrp4bQ8C6J9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nlrp4bQ8C6J9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nlrp4bQ8C6J9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nlrp4bQ8C6J9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nlrp4bQ8C6J9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nlrp4bQ8C6J9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nlrp4bQ8C6J9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nlrp4bQ8C6J9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nlrp4bQ8C6J9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nlrp4bQ8C6J9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nlrp4bQ8C6J9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nlrp4bQ8C6J9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nlrp4bQ8C6J9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nlrp4bQ8C6J9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Nlrp4bQ8C6J9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nlrp4bQ8C6J9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nlrp4bQ8C6J9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nlrp4bQ8C6J9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nlrp4bQ8C6J9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nlrp4bQ8C6J9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nlrp4bQ8C6J9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nlrp4bQ8C6J9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nlrp4bQ8C6J9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nlrp4bQ8C6J9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Nlrp4bQ8C6J9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nlrp4bQ8C6J9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nlrp4bQ8C6J9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nlrp4bQ8C6J9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nlrp4bQ8C6J9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nlrp4bQ8C6J9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Nlrp4bQ8C6J9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nlrp4bQ8C6J9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nlrp4bQ8C6J9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms