Protein–RNA interactions for Protein: Q8BZL8

Lmo3, LIM domain only protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo3Q8BZL8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmo3Q8BZL8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lmo3Q8BZL8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lmo3Q8BZL8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lmo3Q8BZL8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lmo3Q8BZL8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lmo3Q8BZL8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lmo3Q8BZL8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmo3Q8BZL8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmo3Q8BZL8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lmo3Q8BZL8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lmo3Q8BZL8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lmo3Q8BZL8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lmo3Q8BZL8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmo3Q8BZL8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmo3Q8BZL8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmo3Q8BZL8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmo3Q8BZL8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmo3Q8BZL8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmo3Q8BZL8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmo3Q8BZL8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lmo3Q8BZL8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lmo3Q8BZL8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lmo3Q8BZL8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lmo3Q8BZL8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lmo3Q8BZL8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lmo3Q8BZL8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lmo3Q8BZL8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lmo3Q8BZL8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lmo3Q8BZL8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lmo3Q8BZL8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lmo3Q8BZL8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lmo3Q8BZL8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lmo3Q8BZL8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lmo3Q8BZL8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lmo3Q8BZL8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lmo3Q8BZL8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lmo3Q8BZL8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lmo3Q8BZL8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lmo3Q8BZL8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lmo3Q8BZL8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lmo3Q8BZL8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lmo3Q8BZL8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lmo3Q8BZL8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lmo3Q8BZL8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Lmo3Q8BZL8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Lmo3Q8BZL8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lmo3Q8BZL8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lmo3Q8BZL8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lmo3Q8BZL8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lmo3Q8BZL8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lmo3Q8BZL8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lmo3Q8BZL8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lmo3Q8BZL8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lmo3Q8BZL8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lmo3Q8BZL8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmo3Q8BZL8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmo3Q8BZL8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmo3Q8BZL8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmo3Q8BZL8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmo3Q8BZL8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmo3Q8BZL8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmo3Q8BZL8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmo3Q8BZL8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lmo3Q8BZL8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lmo3Q8BZL8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lmo3Q8BZL8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lmo3Q8BZL8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Lmo3Q8BZL8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lmo3Q8BZL8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lmo3Q8BZL8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lmo3Q8BZL8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lmo3Q8BZL8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lmo3Q8BZL8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lmo3Q8BZL8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lmo3Q8BZL8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lmo3Q8BZL8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lmo3Q8BZL8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lmo3Q8BZL8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lmo3Q8BZL8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lmo3Q8BZL8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lmo3Q8BZL8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Lmo3Q8BZL8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lmo3Q8BZL8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Lmo3Q8BZL8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lmo3Q8BZL8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lmo3Q8BZL8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lmo3Q8BZL8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lmo3Q8BZL8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lmo3Q8BZL8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lmo3Q8BZL8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lmo3Q8BZL8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lmo3Q8BZL8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lmo3Q8BZL8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lmo3Q8BZL8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lmo3Q8BZL8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lmo3Q8BZL8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lmo3Q8BZL8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lmo3Q8BZL8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lmo3Q8BZL8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms