Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYK4

Rdh12, Retinol dehydrogenase 12, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh12Q8BYK4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rdh12Q8BYK4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rdh12Q8BYK4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rdh12Q8BYK4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rdh12Q8BYK4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rdh12Q8BYK4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rdh12Q8BYK4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rdh12Q8BYK4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rdh12Q8BYK4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Rdh12Q8BYK4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Rdh12Q8BYK4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rdh12Q8BYK4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rdh12Q8BYK4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rdh12Q8BYK4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rdh12Q8BYK4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rdh12Q8BYK4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rdh12Q8BYK4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rdh12Q8BYK4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rdh12Q8BYK4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rdh12Q8BYK4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rdh12Q8BYK4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rdh12Q8BYK4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rdh12Q8BYK4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rdh12Q8BYK4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rdh12Q8BYK4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rdh12Q8BYK4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rdh12Q8BYK4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rdh12Q8BYK4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rdh12Q8BYK4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rdh12Q8BYK4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rdh12Q8BYK4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rdh12Q8BYK4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rdh12Q8BYK4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rdh12Q8BYK4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rdh12Q8BYK4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rdh12Q8BYK4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rdh12Q8BYK4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rdh12Q8BYK4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rdh12Q8BYK4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rdh12Q8BYK4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rdh12Q8BYK4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rdh12Q8BYK4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rdh12Q8BYK4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rdh12Q8BYK4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Rdh12Q8BYK4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rdh12Q8BYK4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rdh12Q8BYK4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rdh12Q8BYK4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rdh12Q8BYK4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rdh12Q8BYK4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rdh12Q8BYK4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rdh12Q8BYK4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rdh12Q8BYK4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rdh12Q8BYK4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rdh12Q8BYK4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rdh12Q8BYK4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rdh12Q8BYK4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rdh12Q8BYK4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rdh12Q8BYK4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rdh12Q8BYK4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rdh12Q8BYK4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rdh12Q8BYK4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rdh12Q8BYK4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rdh12Q8BYK4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rdh12Q8BYK4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rdh12Q8BYK4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rdh12Q8BYK4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rdh12Q8BYK4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rdh12Q8BYK4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rdh12Q8BYK4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rdh12Q8BYK4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rdh12Q8BYK4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rdh12Q8BYK4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rdh12Q8BYK4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rdh12Q8BYK4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rdh12Q8BYK4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rdh12Q8BYK4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rdh12Q8BYK4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rdh12Q8BYK4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rdh12Q8BYK4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rdh12Q8BYK4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rdh12Q8BYK4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rdh12Q8BYK4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rdh12Q8BYK4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rdh12Q8BYK4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rdh12Q8BYK4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rdh12Q8BYK4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rdh12Q8BYK4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rdh12Q8BYK4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rdh12Q8BYK4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rdh12Q8BYK4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rdh12Q8BYK4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rdh12Q8BYK4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rdh12Q8BYK4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rdh12Q8BYK4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rdh12Q8BYK4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rdh12Q8BYK4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rdh12Q8BYK4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rdh12Q8BYK4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rdh12Q8BYK4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101 ms