Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXX9

Ccdc169, Coiled-coil domain-containing protein 169, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc169Q8BXX9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc169Q8BXX9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc169Q8BXX9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc169Q8BXX9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc169Q8BXX9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc169Q8BXX9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc169Q8BXX9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc169Q8BXX9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc169Q8BXX9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc169Q8BXX9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc169Q8BXX9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc169Q8BXX9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc169Q8BXX9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc169Q8BXX9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc169Q8BXX9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc169Q8BXX9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc169Q8BXX9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccdc169Q8BXX9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc169Q8BXX9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc169Q8BXX9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc169Q8BXX9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc169Q8BXX9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc169Q8BXX9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc169Q8BXX9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc169Q8BXX9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc169Q8BXX9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc169Q8BXX9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc169Q8BXX9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc169Q8BXX9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc169Q8BXX9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc169Q8BXX9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc169Q8BXX9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc169Q8BXX9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc169Q8BXX9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc169Q8BXX9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc169Q8BXX9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc169Q8BXX9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc169Q8BXX9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc169Q8BXX9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc169Q8BXX9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc169Q8BXX9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc169Q8BXX9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc169Q8BXX9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc169Q8BXX9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc169Q8BXX9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc169Q8BXX9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc169Q8BXX9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc169Q8BXX9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc169Q8BXX9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc169Q8BXX9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc169Q8BXX9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc169Q8BXX9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc169Q8BXX9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc169Q8BXX9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc169Q8BXX9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc169Q8BXX9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc169Q8BXX9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc169Q8BXX9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc169Q8BXX9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc169Q8BXX9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc169Q8BXX9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc169Q8BXX9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc169Q8BXX9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc169Q8BXX9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc169Q8BXX9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc169Q8BXX9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc169Q8BXX9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc169Q8BXX9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc169Q8BXX9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc169Q8BXX9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc169Q8BXX9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc169Q8BXX9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc169Q8BXX9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc169Q8BXX9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc169Q8BXX9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc169Q8BXX9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc169Q8BXX9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc169Q8BXX9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc169Q8BXX9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc169Q8BXX9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc169Q8BXX9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc169Q8BXX9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc169Q8BXX9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc169Q8BXX9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc169Q8BXX9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc169Q8BXX9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc169Q8BXX9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc169Q8BXX9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc169Q8BXX9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc169Q8BXX9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc169Q8BXX9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc169Q8BXX9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc169Q8BXX9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc169Q8BXX9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc169Q8BXX9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc169Q8BXX9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc169Q8BXX9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc169Q8BXX9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc169Q8BXX9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc169Q8BXX9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 159.9 ms