Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX22

Sall4, Sal-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall4Q8BX22 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sall4Q8BX22 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sall4Q8BX22 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sall4Q8BX22 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sall4Q8BX22 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sall4Q8BX22 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sall4Q8BX22 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sall4Q8BX22 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sall4Q8BX22 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sall4Q8BX22 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sall4Q8BX22 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Sall4Q8BX22 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sall4Q8BX22 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sall4Q8BX22 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sall4Q8BX22 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sall4Q8BX22 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sall4Q8BX22 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sall4Q8BX22 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sall4Q8BX22 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sall4Q8BX22 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sall4Q8BX22 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sall4Q8BX22 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sall4Q8BX22 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sall4Q8BX22 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sall4Q8BX22 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sall4Q8BX22 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sall4Q8BX22 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Sall4Q8BX22 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sall4Q8BX22 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sall4Q8BX22 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sall4Q8BX22 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sall4Q8BX22 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sall4Q8BX22 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sall4Q8BX22 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sall4Q8BX22 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sall4Q8BX22 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sall4Q8BX22 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sall4Q8BX22 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sall4Q8BX22 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sall4Q8BX22 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sall4Q8BX22 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sall4Q8BX22 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sall4Q8BX22 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sall4Q8BX22 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sall4Q8BX22 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sall4Q8BX22 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sall4Q8BX22 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Sall4Q8BX22 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sall4Q8BX22 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sall4Q8BX22 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sall4Q8BX22 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sall4Q8BX22 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sall4Q8BX22 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sall4Q8BX22 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sall4Q8BX22 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sall4Q8BX22 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sall4Q8BX22 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sall4Q8BX22 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sall4Q8BX22 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sall4Q8BX22 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sall4Q8BX22 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sall4Q8BX22 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sall4Q8BX22 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sall4Q8BX22 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sall4Q8BX22 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sall4Q8BX22 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sall4Q8BX22 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sall4Q8BX22 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sall4Q8BX22 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sall4Q8BX22 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sall4Q8BX22 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sall4Q8BX22 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sall4Q8BX22 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sall4Q8BX22 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Sall4Q8BX22 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Sall4Q8BX22 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sall4Q8BX22 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sall4Q8BX22 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Sall4Q8BX22 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sall4Q8BX22 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sall4Q8BX22 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sall4Q8BX22 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sall4Q8BX22 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sall4Q8BX22 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sall4Q8BX22 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sall4Q8BX22 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sall4Q8BX22 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sall4Q8BX22 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sall4Q8BX22 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sall4Q8BX22 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sall4Q8BX22 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sall4Q8BX22 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sall4Q8BX22 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sall4Q8BX22 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sall4Q8BX22 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sall4Q8BX22 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sall4Q8BX22 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sall4Q8BX22 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sall4Q8BX22 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sall4Q8BX22 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms