Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ube3dQ8BX13 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ube3dQ8BX13 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ube3dQ8BX13 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ube3dQ8BX13 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ube3dQ8BX13 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ube3dQ8BX13 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ube3dQ8BX13 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ube3dQ8BX13 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ube3dQ8BX13 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ube3dQ8BX13 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ube3dQ8BX13 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ube3dQ8BX13 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ube3dQ8BX13 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ube3dQ8BX13 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ube3dQ8BX13 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ube3dQ8BX13 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ube3dQ8BX13 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ube3dQ8BX13 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ube3dQ8BX13 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ube3dQ8BX13 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ube3dQ8BX13 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ube3dQ8BX13 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ube3dQ8BX13 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ube3dQ8BX13 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ube3dQ8BX13 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ube3dQ8BX13 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ube3dQ8BX13 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ube3dQ8BX13 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ube3dQ8BX13 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ube3dQ8BX13 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ube3dQ8BX13 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ube3dQ8BX13 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ube3dQ8BX13 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ube3dQ8BX13 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ube3dQ8BX13 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ube3dQ8BX13 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ube3dQ8BX13 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ube3dQ8BX13 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ube3dQ8BX13 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ube3dQ8BX13 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ube3dQ8BX13 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ube3dQ8BX13 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ube3dQ8BX13 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ube3dQ8BX13 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ube3dQ8BX13 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ube3dQ8BX13 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ube3dQ8BX13 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ube3dQ8BX13 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ube3dQ8BX13 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ube3dQ8BX13 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ube3dQ8BX13 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ube3dQ8BX13 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ube3dQ8BX13 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ube3dQ8BX13 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ube3dQ8BX13 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ube3dQ8BX13 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ube3dQ8BX13 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ube3dQ8BX13 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ube3dQ8BX13 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ube3dQ8BX13 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ube3dQ8BX13 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ube3dQ8BX13 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ube3dQ8BX13 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ube3dQ8BX13 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ube3dQ8BX13 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ube3dQ8BX13 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ube3dQ8BX13 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ube3dQ8BX13 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ube3dQ8BX13 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ube3dQ8BX13 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ube3dQ8BX13 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ube3dQ8BX13 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ube3dQ8BX13 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ube3dQ8BX13 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ube3dQ8BX13 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ube3dQ8BX13 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ube3dQ8BX13 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ube3dQ8BX13 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ube3dQ8BX13 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ube3dQ8BX13 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ube3dQ8BX13 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ube3dQ8BX13 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ube3dQ8BX13 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ube3dQ8BX13 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ube3dQ8BX13 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ube3dQ8BX13 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ube3dQ8BX13 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ube3dQ8BX13 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ube3dQ8BX13 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ube3dQ8BX13 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ube3dQ8BX13 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ube3dQ8BX13 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ube3dQ8BX13 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ube3dQ8BX13 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ube3dQ8BX13 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ube3dQ8BX13 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ube3dQ8BX13 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ube3dQ8BX13 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ube3dQ8BX13 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms