Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ08

5730596B20Rik, RIKEN cDNA 5730596B20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730596B20RikQ8BQ08 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
5730596B20RikQ8BQ08 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
5730596B20RikQ8BQ08 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
5730596B20RikQ8BQ08 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
5730596B20RikQ8BQ08 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
5730596B20RikQ8BQ08 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
5730596B20RikQ8BQ08 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
5730596B20RikQ8BQ08 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
5730596B20RikQ8BQ08 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
5730596B20RikQ8BQ08 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
5730596B20RikQ8BQ08 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
5730596B20RikQ8BQ08 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
5730596B20RikQ8BQ08 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
5730596B20RikQ8BQ08 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
5730596B20RikQ8BQ08 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
5730596B20RikQ8BQ08 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
5730596B20RikQ8BQ08 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
5730596B20RikQ8BQ08 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
5730596B20RikQ8BQ08 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
5730596B20RikQ8BQ08 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
5730596B20RikQ8BQ08 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
5730596B20RikQ8BQ08 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
5730596B20RikQ8BQ08 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
5730596B20RikQ8BQ08 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
5730596B20RikQ8BQ08 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
5730596B20RikQ8BQ08 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
5730596B20RikQ8BQ08 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
5730596B20RikQ8BQ08 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
5730596B20RikQ8BQ08 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
5730596B20RikQ8BQ08 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
5730596B20RikQ8BQ08 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
5730596B20RikQ8BQ08 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
5730596B20RikQ8BQ08 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
5730596B20RikQ8BQ08 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
5730596B20RikQ8BQ08 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
5730596B20RikQ8BQ08 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
5730596B20RikQ8BQ08 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
5730596B20RikQ8BQ08 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
5730596B20RikQ8BQ08 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
5730596B20RikQ8BQ08 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
5730596B20RikQ8BQ08 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
5730596B20RikQ8BQ08 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
5730596B20RikQ8BQ08 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
5730596B20RikQ8BQ08 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
5730596B20RikQ8BQ08 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
5730596B20RikQ8BQ08 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
5730596B20RikQ8BQ08 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
5730596B20RikQ8BQ08 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
5730596B20RikQ8BQ08 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
5730596B20RikQ8BQ08 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
5730596B20RikQ8BQ08 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
5730596B20RikQ8BQ08 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
5730596B20RikQ8BQ08 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
5730596B20RikQ8BQ08 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
5730596B20RikQ8BQ08 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
5730596B20RikQ8BQ08 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
5730596B20RikQ8BQ08 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
5730596B20RikQ8BQ08 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
5730596B20RikQ8BQ08 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
5730596B20RikQ8BQ08 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
5730596B20RikQ8BQ08 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
5730596B20RikQ8BQ08 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
5730596B20RikQ8BQ08 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
5730596B20RikQ8BQ08 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
5730596B20RikQ8BQ08 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
5730596B20RikQ8BQ08 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
5730596B20RikQ8BQ08 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
5730596B20RikQ8BQ08 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
5730596B20RikQ8BQ08 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
5730596B20RikQ8BQ08 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
5730596B20RikQ8BQ08 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
5730596B20RikQ8BQ08 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
5730596B20RikQ8BQ08 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
5730596B20RikQ8BQ08 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
5730596B20RikQ8BQ08 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
5730596B20RikQ8BQ08 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
5730596B20RikQ8BQ08 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
5730596B20RikQ8BQ08 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
5730596B20RikQ8BQ08 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
5730596B20RikQ8BQ08 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
5730596B20RikQ8BQ08 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
5730596B20RikQ8BQ08 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
5730596B20RikQ8BQ08 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5730596B20RikQ8BQ08 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5730596B20RikQ8BQ08 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5730596B20RikQ8BQ08 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
5730596B20RikQ8BQ08 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5730596B20RikQ8BQ08 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
5730596B20RikQ8BQ08 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5730596B20RikQ8BQ08 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5730596B20RikQ8BQ08 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5730596B20RikQ8BQ08 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5730596B20RikQ8BQ08 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
5730596B20RikQ8BQ08 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
5730596B20RikQ8BQ08 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
5730596B20RikQ8BQ08 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
5730596B20RikQ8BQ08 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
5730596B20RikQ8BQ08 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
5730596B20RikQ8BQ08 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
5730596B20RikQ8BQ08 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms