Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI0

Fbxo38, F-box only protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo38Q8BMI0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fbxo38Q8BMI0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fbxo38Q8BMI0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fbxo38Q8BMI0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fbxo38Q8BMI0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fbxo38Q8BMI0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fbxo38Q8BMI0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fbxo38Q8BMI0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fbxo38Q8BMI0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fbxo38Q8BMI0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fbxo38Q8BMI0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fbxo38Q8BMI0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fbxo38Q8BMI0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fbxo38Q8BMI0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Fbxo38Q8BMI0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fbxo38Q8BMI0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fbxo38Q8BMI0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fbxo38Q8BMI0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fbxo38Q8BMI0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fbxo38Q8BMI0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fbxo38Q8BMI0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fbxo38Q8BMI0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fbxo38Q8BMI0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fbxo38Q8BMI0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Fbxo38Q8BMI0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fbxo38Q8BMI0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fbxo38Q8BMI0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fbxo38Q8BMI0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fbxo38Q8BMI0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fbxo38Q8BMI0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fbxo38Q8BMI0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fbxo38Q8BMI0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fbxo38Q8BMI0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fbxo38Q8BMI0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fbxo38Q8BMI0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Fbxo38Q8BMI0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fbxo38Q8BMI0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fbxo38Q8BMI0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Fbxo38Q8BMI0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Fbxo38Q8BMI0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fbxo38Q8BMI0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Fbxo38Q8BMI0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fbxo38Q8BMI0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fbxo38Q8BMI0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fbxo38Q8BMI0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fbxo38Q8BMI0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fbxo38Q8BMI0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fbxo38Q8BMI0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fbxo38Q8BMI0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Fbxo38Q8BMI0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fbxo38Q8BMI0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fbxo38Q8BMI0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fbxo38Q8BMI0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Fbxo38Q8BMI0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fbxo38Q8BMI0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fbxo38Q8BMI0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fbxo38Q8BMI0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fbxo38Q8BMI0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fbxo38Q8BMI0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Fbxo38Q8BMI0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fbxo38Q8BMI0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Fbxo38Q8BMI0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fbxo38Q8BMI0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fbxo38Q8BMI0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fbxo38Q8BMI0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Fbxo38Q8BMI0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Fbxo38Q8BMI0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fbxo38Q8BMI0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fbxo38Q8BMI0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fbxo38Q8BMI0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fbxo38Q8BMI0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fbxo38Q8BMI0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fbxo38Q8BMI0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fbxo38Q8BMI0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fbxo38Q8BMI0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fbxo38Q8BMI0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fbxo38Q8BMI0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Fbxo38Q8BMI0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fbxo38Q8BMI0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fbxo38Q8BMI0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fbxo38Q8BMI0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fbxo38Q8BMI0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fbxo38Q8BMI0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fbxo38Q8BMI0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fbxo38Q8BMI0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fbxo38Q8BMI0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fbxo38Q8BMI0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fbxo38Q8BMI0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fbxo38Q8BMI0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fbxo38Q8BMI0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fbxo38Q8BMI0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fbxo38Q8BMI0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fbxo38Q8BMI0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fbxo38Q8BMI0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fbxo38Q8BMI0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fbxo38Q8BMI0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fbxo38Q8BMI0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fbxo38Q8BMI0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fbxo38Q8BMI0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fbxo38Q8BMI0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms