Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF3

Me3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me3Q8BMF3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Me3Q8BMF3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Me3Q8BMF3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Me3Q8BMF3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Me3Q8BMF3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Me3Q8BMF3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Me3Q8BMF3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Me3Q8BMF3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Me3Q8BMF3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Me3Q8BMF3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Me3Q8BMF3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Me3Q8BMF3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Me3Q8BMF3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Me3Q8BMF3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Me3Q8BMF3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Me3Q8BMF3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Me3Q8BMF3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Me3Q8BMF3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Me3Q8BMF3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Me3Q8BMF3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Me3Q8BMF3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Me3Q8BMF3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Me3Q8BMF3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Me3Q8BMF3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Me3Q8BMF3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Me3Q8BMF3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Me3Q8BMF3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Me3Q8BMF3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Me3Q8BMF3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Me3Q8BMF3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Me3Q8BMF3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Me3Q8BMF3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Me3Q8BMF3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Me3Q8BMF3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Me3Q8BMF3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Me3Q8BMF3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Me3Q8BMF3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Me3Q8BMF3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Me3Q8BMF3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Me3Q8BMF3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Me3Q8BMF3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Me3Q8BMF3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Me3Q8BMF3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Me3Q8BMF3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Me3Q8BMF3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Me3Q8BMF3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Me3Q8BMF3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Me3Q8BMF3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Me3Q8BMF3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Me3Q8BMF3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Me3Q8BMF3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Me3Q8BMF3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Me3Q8BMF3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Me3Q8BMF3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Me3Q8BMF3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Me3Q8BMF3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Me3Q8BMF3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Me3Q8BMF3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Me3Q8BMF3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Me3Q8BMF3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Me3Q8BMF3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Me3Q8BMF3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Me3Q8BMF3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Me3Q8BMF3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Me3Q8BMF3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Me3Q8BMF3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Me3Q8BMF3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Me3Q8BMF3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Me3Q8BMF3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Me3Q8BMF3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Me3Q8BMF3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Me3Q8BMF3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Me3Q8BMF3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Me3Q8BMF3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Me3Q8BMF3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Me3Q8BMF3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Me3Q8BMF3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Me3Q8BMF3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Me3Q8BMF3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Me3Q8BMF3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Me3Q8BMF3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Me3Q8BMF3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Me3Q8BMF3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Me3Q8BMF3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Me3Q8BMF3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Me3Q8BMF3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Me3Q8BMF3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Me3Q8BMF3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Me3Q8BMF3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Me3Q8BMF3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Me3Q8BMF3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Me3Q8BMF3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Me3Q8BMF3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Me3Q8BMF3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Me3Q8BMF3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Me3Q8BMF3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Me3Q8BMF3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Me3Q8BMF3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Me3Q8BMF3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Me3Q8BMF3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms