Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLH7

Hirip3, HIRA-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hirip3Q8BLH7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Hirip3Q8BLH7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Hirip3Q8BLH7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Hirip3Q8BLH7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Hirip3Q8BLH7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Hirip3Q8BLH7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Hirip3Q8BLH7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Hirip3Q8BLH7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Hirip3Q8BLH7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Hirip3Q8BLH7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Hirip3Q8BLH7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Hirip3Q8BLH7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Hirip3Q8BLH7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Hirip3Q8BLH7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Hirip3Q8BLH7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Hirip3Q8BLH7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Hirip3Q8BLH7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Hirip3Q8BLH7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Hirip3Q8BLH7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Hirip3Q8BLH7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Hirip3Q8BLH7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Hirip3Q8BLH7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Hirip3Q8BLH7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Hirip3Q8BLH7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Hirip3Q8BLH7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Hirip3Q8BLH7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Hirip3Q8BLH7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Hirip3Q8BLH7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Hirip3Q8BLH7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Hirip3Q8BLH7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Hirip3Q8BLH7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Hirip3Q8BLH7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Hirip3Q8BLH7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Hirip3Q8BLH7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Hirip3Q8BLH7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Hirip3Q8BLH7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Hirip3Q8BLH7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Hirip3Q8BLH7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Hirip3Q8BLH7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Hirip3Q8BLH7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Hirip3Q8BLH7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Hirip3Q8BLH7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Hirip3Q8BLH7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Hirip3Q8BLH7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Hirip3Q8BLH7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Hirip3Q8BLH7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Hirip3Q8BLH7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Hirip3Q8BLH7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Hirip3Q8BLH7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Hirip3Q8BLH7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Hirip3Q8BLH7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Hirip3Q8BLH7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Hirip3Q8BLH7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Hirip3Q8BLH7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Hirip3Q8BLH7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Hirip3Q8BLH7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Hirip3Q8BLH7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Hirip3Q8BLH7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Hirip3Q8BLH7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Hirip3Q8BLH7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Hirip3Q8BLH7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Hirip3Q8BLH7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Hirip3Q8BLH7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Hirip3Q8BLH7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Hirip3Q8BLH7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Hirip3Q8BLH7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Hirip3Q8BLH7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Hirip3Q8BLH7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Hirip3Q8BLH7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Hirip3Q8BLH7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Hirip3Q8BLH7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Hirip3Q8BLH7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Hirip3Q8BLH7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Hirip3Q8BLH7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Hirip3Q8BLH7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Hirip3Q8BLH7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Hirip3Q8BLH7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Hirip3Q8BLH7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Hirip3Q8BLH7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Hirip3Q8BLH7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Hirip3Q8BLH7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Hirip3Q8BLH7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Hirip3Q8BLH7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Hirip3Q8BLH7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Hirip3Q8BLH7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Hirip3Q8BLH7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Hirip3Q8BLH7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Hirip3Q8BLH7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Hirip3Q8BLH7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Hirip3Q8BLH7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Hirip3Q8BLH7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Hirip3Q8BLH7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Hirip3Q8BLH7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Hirip3Q8BLH7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Hirip3Q8BLH7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Hirip3Q8BLH7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Hirip3Q8BLH7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Hirip3Q8BLH7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Hirip3Q8BLH7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Hirip3Q8BLH7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms