Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLH7

Hirip3, HIRA-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hirip3Q8BLH7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Hirip3Q8BLH7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Hirip3Q8BLH7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Hirip3Q8BLH7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC29,03■■■□□ 2,24
Hirip3Q8BLH7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC29,03■■■□□ 2,24
Hirip3Q8BLH7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC29,03■■■□□ 2,24
Hirip3Q8BLH7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Hirip3Q8BLH7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Hirip3Q8BLH7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC29,02■■■□□ 2,24
Hirip3Q8BLH7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Hirip3Q8BLH7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Hirip3Q8BLH7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Hirip3Q8BLH7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Hirip3Q8BLH7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Hirip3Q8BLH7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC29,01■■■□□ 2,23
Hirip3Q8BLH7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Hirip3Q8BLH7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Hirip3Q8BLH7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Hirip3Q8BLH7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Hirip3Q8BLH7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Hirip3Q8BLH7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC29■■■□□ 2,23
Hirip3Q8BLH7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Hirip3Q8BLH7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Hirip3Q8BLH7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Hirip3Q8BLH7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,99■■■□□ 2,23
Hirip3Q8BLH7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC28,98■■■□□ 2,23
Hirip3Q8BLH7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Hirip3Q8BLH7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28,97■■■□□ 2,23
Hirip3Q8BLH7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Hirip3Q8BLH7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Hirip3Q8BLH7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,97■■■□□ 2,23
Hirip3Q8BLH7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Hirip3Q8BLH7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28,96■■■□□ 2,23
Hirip3Q8BLH7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28,95■■■□□ 2,22
Hirip3Q8BLH7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Hirip3Q8BLH7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Hirip3Q8BLH7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Hirip3Q8BLH7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28,93■■■□□ 2,22
Hirip3Q8BLH7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28,92■■■□□ 2,22
Hirip3Q8BLH7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC28,91■■■□□ 2,22
Hirip3Q8BLH7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Hirip3Q8BLH7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Hirip3Q8BLH7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
Hirip3Q8BLH7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
Hirip3Q8BLH7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,21
Hirip3Q8BLH7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Hirip3Q8BLH7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Hirip3Q8BLH7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Hirip3Q8BLH7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC28,86■■■□□ 2,21
Hirip3Q8BLH7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28,86■■■□□ 2,21
Hirip3Q8BLH7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Hirip3Q8BLH7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,85■■■□□ 2,21
Hirip3Q8BLH7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,84■■■□□ 2,21
Hirip3Q8BLH7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Hirip3Q8BLH7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28,84■■■□□ 2,21
Hirip3Q8BLH7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28,83■■■□□ 2,21
Hirip3Q8BLH7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Hirip3Q8BLH7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Hirip3Q8BLH7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC28,83■■■□□ 2,21
Hirip3Q8BLH7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Hirip3Q8BLH7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28,82■■■□□ 2,2
Hirip3Q8BLH7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28,82■■■□□ 2,2
Hirip3Q8BLH7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,81■■■□□ 2,2
Hirip3Q8BLH7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Hirip3Q8BLH7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Hirip3Q8BLH7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Hirip3Q8BLH7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Hirip3Q8BLH7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Hirip3Q8BLH7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28,78■■■□□ 2,2
Hirip3Q8BLH7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28,77■■■□□ 2,2
Hirip3Q8BLH7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Hirip3Q8BLH7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC28,76■■■□□ 2,19
Hirip3Q8BLH7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Hirip3Q8BLH7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,75■■■□□ 2,19
Hirip3Q8BLH7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28,75■■■□□ 2,19
Hirip3Q8BLH7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28,75■■■□□ 2,19
Hirip3Q8BLH7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Hirip3Q8BLH7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC28,75■■■□□ 2,19
Hirip3Q8BLH7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Hirip3Q8BLH7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Hirip3Q8BLH7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Hirip3Q8BLH7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Hirip3Q8BLH7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Hirip3Q8BLH7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Hirip3Q8BLH7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Hirip3Q8BLH7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Hirip3Q8BLH7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Hirip3Q8BLH7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Hirip3Q8BLH7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Hirip3Q8BLH7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Hirip3Q8BLH7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Hirip3Q8BLH7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28,7■■■□□ 2,18
Hirip3Q8BLH7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28,69■■■□□ 2,18
Hirip3Q8BLH7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Hirip3Q8BLH7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28,69■■■□□ 2,18
Hirip3Q8BLH7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Hirip3Q8BLH7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Hirip3Q8BLH7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,69■■■□□ 2,18
Hirip3Q8BLH7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28,69■■■□□ 2,18
Hirip3Q8BLH7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms