Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKU8

Tmem87b, Transmembrane protein 87B, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem87bQ8BKU8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Tmem87bQ8BKU8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tmem87bQ8BKU8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tmem87bQ8BKU8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tmem87bQ8BKU8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tmem87bQ8BKU8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tmem87bQ8BKU8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tmem87bQ8BKU8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Tmem87bQ8BKU8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tmem87bQ8BKU8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tmem87bQ8BKU8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Tmem87bQ8BKU8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tmem87bQ8BKU8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tmem87bQ8BKU8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Tmem87bQ8BKU8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tmem87bQ8BKU8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tmem87bQ8BKU8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tmem87bQ8BKU8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tmem87bQ8BKU8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tmem87bQ8BKU8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tmem87bQ8BKU8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tmem87bQ8BKU8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Tmem87bQ8BKU8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tmem87bQ8BKU8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tmem87bQ8BKU8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tmem87bQ8BKU8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tmem87bQ8BKU8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tmem87bQ8BKU8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tmem87bQ8BKU8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Tmem87bQ8BKU8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tmem87bQ8BKU8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tmem87bQ8BKU8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Tmem87bQ8BKU8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tmem87bQ8BKU8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tmem87bQ8BKU8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tmem87bQ8BKU8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tmem87bQ8BKU8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tmem87bQ8BKU8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tmem87bQ8BKU8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tmem87bQ8BKU8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tmem87bQ8BKU8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tmem87bQ8BKU8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tmem87bQ8BKU8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tmem87bQ8BKU8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tmem87bQ8BKU8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tmem87bQ8BKU8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tmem87bQ8BKU8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tmem87bQ8BKU8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Tmem87bQ8BKU8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tmem87bQ8BKU8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tmem87bQ8BKU8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tmem87bQ8BKU8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Tmem87bQ8BKU8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tmem87bQ8BKU8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tmem87bQ8BKU8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Tmem87bQ8BKU8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tmem87bQ8BKU8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tmem87bQ8BKU8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tmem87bQ8BKU8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tmem87bQ8BKU8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tmem87bQ8BKU8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tmem87bQ8BKU8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tmem87bQ8BKU8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tmem87bQ8BKU8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tmem87bQ8BKU8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tmem87bQ8BKU8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tmem87bQ8BKU8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tmem87bQ8BKU8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tmem87bQ8BKU8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tmem87bQ8BKU8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tmem87bQ8BKU8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tmem87bQ8BKU8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tmem87bQ8BKU8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tmem87bQ8BKU8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tmem87bQ8BKU8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tmem87bQ8BKU8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tmem87bQ8BKU8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tmem87bQ8BKU8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tmem87bQ8BKU8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tmem87bQ8BKU8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tmem87bQ8BKU8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tmem87bQ8BKU8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tmem87bQ8BKU8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tmem87bQ8BKU8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tmem87bQ8BKU8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tmem87bQ8BKU8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tmem87bQ8BKU8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tmem87bQ8BKU8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tmem87bQ8BKU8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tmem87bQ8BKU8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tmem87bQ8BKU8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tmem87bQ8BKU8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tmem87bQ8BKU8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tmem87bQ8BKU8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tmem87bQ8BKU8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tmem87bQ8BKU8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tmem87bQ8BKU8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tmem87bQ8BKU8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tmem87bQ8BKU8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tmem87bQ8BKU8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms