Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smarcal1Q8BJL0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smarcal1Q8BJL0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Smarcal1Q8BJL0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smarcal1Q8BJL0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smarcal1Q8BJL0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Smarcal1Q8BJL0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Smarcal1Q8BJL0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smarcal1Q8BJL0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarcal1Q8BJL0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarcal1Q8BJL0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smarcal1Q8BJL0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smarcal1Q8BJL0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Smarcal1Q8BJL0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smarcal1Q8BJL0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smarcal1Q8BJL0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smarcal1Q8BJL0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smarcal1Q8BJL0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smarcal1Q8BJL0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smarcal1Q8BJL0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Smarcal1Q8BJL0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smarcal1Q8BJL0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarcal1Q8BJL0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarcal1Q8BJL0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarcal1Q8BJL0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarcal1Q8BJL0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarcal1Q8BJL0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarcal1Q8BJL0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarcal1Q8BJL0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smarcal1Q8BJL0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smarcal1Q8BJL0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smarcal1Q8BJL0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smarcal1Q8BJL0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smarcal1Q8BJL0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smarcal1Q8BJL0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smarcal1Q8BJL0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smarcal1Q8BJL0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smarcal1Q8BJL0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smarcal1Q8BJL0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smarcal1Q8BJL0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smarcal1Q8BJL0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smarcal1Q8BJL0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Smarcal1Q8BJL0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smarcal1Q8BJL0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smarcal1Q8BJL0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smarcal1Q8BJL0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smarcal1Q8BJL0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smarcal1Q8BJL0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smarcal1Q8BJL0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smarcal1Q8BJL0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smarcal1Q8BJL0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smarcal1Q8BJL0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smarcal1Q8BJL0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smarcal1Q8BJL0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smarcal1Q8BJL0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarcal1Q8BJL0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarcal1Q8BJL0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarcal1Q8BJL0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarcal1Q8BJL0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarcal1Q8BJL0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarcal1Q8BJL0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarcal1Q8BJL0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarcal1Q8BJL0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smarcal1Q8BJL0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smarcal1Q8BJL0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smarcal1Q8BJL0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smarcal1Q8BJL0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smarcal1Q8BJL0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Smarcal1Q8BJL0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Smarcal1Q8BJL0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Smarcal1Q8BJL0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarcal1Q8BJL0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarcal1Q8BJL0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarcal1Q8BJL0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarcal1Q8BJL0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarcal1Q8BJL0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smarcal1Q8BJL0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smarcal1Q8BJL0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Smarcal1Q8BJL0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smarcal1Q8BJL0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarcal1Q8BJL0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarcal1Q8BJL0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarcal1Q8BJL0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarcal1Q8BJL0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarcal1Q8BJL0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarcal1Q8BJL0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarcal1Q8BJL0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarcal1Q8BJL0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smarcal1Q8BJL0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smarcal1Q8BJL0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smarcal1Q8BJL0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smarcal1Q8BJL0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smarcal1Q8BJL0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Smarcal1Q8BJL0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smarcal1Q8BJL0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Smarcal1Q8BJL0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smarcal1Q8BJL0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smarcal1Q8BJL0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smarcal1Q8BJL0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smarcal1Q8BJL0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms