Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIW9

Chtf18, Chromosome transmission fidelity protein 18 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 969 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chtf18Q8BIW9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Chtf18Q8BIW9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chtf18Q8BIW9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chtf18Q8BIW9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chtf18Q8BIW9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chtf18Q8BIW9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Chtf18Q8BIW9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chtf18Q8BIW9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chtf18Q8BIW9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chtf18Q8BIW9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chtf18Q8BIW9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chtf18Q8BIW9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chtf18Q8BIW9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chtf18Q8BIW9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chtf18Q8BIW9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chtf18Q8BIW9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chtf18Q8BIW9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chtf18Q8BIW9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chtf18Q8BIW9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Chtf18Q8BIW9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Chtf18Q8BIW9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chtf18Q8BIW9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chtf18Q8BIW9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chtf18Q8BIW9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chtf18Q8BIW9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chtf18Q8BIW9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chtf18Q8BIW9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chtf18Q8BIW9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chtf18Q8BIW9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chtf18Q8BIW9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chtf18Q8BIW9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chtf18Q8BIW9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chtf18Q8BIW9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chtf18Q8BIW9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chtf18Q8BIW9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chtf18Q8BIW9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chtf18Q8BIW9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chtf18Q8BIW9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chtf18Q8BIW9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chtf18Q8BIW9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chtf18Q8BIW9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chtf18Q8BIW9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chtf18Q8BIW9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chtf18Q8BIW9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chtf18Q8BIW9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chtf18Q8BIW9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chtf18Q8BIW9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chtf18Q8BIW9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Chtf18Q8BIW9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chtf18Q8BIW9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chtf18Q8BIW9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chtf18Q8BIW9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chtf18Q8BIW9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chtf18Q8BIW9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chtf18Q8BIW9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Chtf18Q8BIW9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Chtf18Q8BIW9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chtf18Q8BIW9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chtf18Q8BIW9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chtf18Q8BIW9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chtf18Q8BIW9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chtf18Q8BIW9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Chtf18Q8BIW9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chtf18Q8BIW9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chtf18Q8BIW9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chtf18Q8BIW9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chtf18Q8BIW9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chtf18Q8BIW9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chtf18Q8BIW9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chtf18Q8BIW9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Chtf18Q8BIW9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chtf18Q8BIW9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chtf18Q8BIW9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chtf18Q8BIW9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chtf18Q8BIW9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chtf18Q8BIW9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chtf18Q8BIW9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chtf18Q8BIW9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chtf18Q8BIW9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chtf18Q8BIW9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chtf18Q8BIW9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chtf18Q8BIW9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chtf18Q8BIW9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chtf18Q8BIW9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chtf18Q8BIW9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chtf18Q8BIW9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chtf18Q8BIW9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chtf18Q8BIW9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chtf18Q8BIW9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chtf18Q8BIW9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chtf18Q8BIW9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chtf18Q8BIW9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chtf18Q8BIW9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chtf18Q8BIW9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chtf18Q8BIW9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chtf18Q8BIW9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chtf18Q8BIW9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chtf18Q8BIW9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chtf18Q8BIW9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chtf18Q8BIW9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms