Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIW1

Prune1, Exopolyphosphatase PRUNE1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune1Q8BIW1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Prune1Q8BIW1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Prune1Q8BIW1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Prune1Q8BIW1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Prune1Q8BIW1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Prune1Q8BIW1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Prune1Q8BIW1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Prune1Q8BIW1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Prune1Q8BIW1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Prune1Q8BIW1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Prune1Q8BIW1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Prune1Q8BIW1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Prune1Q8BIW1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Prune1Q8BIW1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Prune1Q8BIW1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Prune1Q8BIW1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Prune1Q8BIW1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Prune1Q8BIW1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Prune1Q8BIW1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Prune1Q8BIW1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Prune1Q8BIW1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Prune1Q8BIW1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Prune1Q8BIW1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Prune1Q8BIW1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Prune1Q8BIW1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Prune1Q8BIW1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Prune1Q8BIW1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Prune1Q8BIW1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Prune1Q8BIW1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Prune1Q8BIW1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Prune1Q8BIW1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Prune1Q8BIW1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Prune1Q8BIW1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Prune1Q8BIW1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Prune1Q8BIW1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Prune1Q8BIW1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Prune1Q8BIW1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Prune1Q8BIW1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Prune1Q8BIW1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Prune1Q8BIW1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Prune1Q8BIW1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Prune1Q8BIW1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Prune1Q8BIW1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Prune1Q8BIW1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Prune1Q8BIW1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Prune1Q8BIW1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Prune1Q8BIW1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Prune1Q8BIW1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Prune1Q8BIW1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Prune1Q8BIW1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Prune1Q8BIW1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Prune1Q8BIW1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Prune1Q8BIW1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Prune1Q8BIW1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Prune1Q8BIW1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Prune1Q8BIW1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Prune1Q8BIW1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Prune1Q8BIW1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Prune1Q8BIW1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Prune1Q8BIW1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Prune1Q8BIW1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Prune1Q8BIW1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Prune1Q8BIW1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Prune1Q8BIW1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Prune1Q8BIW1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Prune1Q8BIW1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Prune1Q8BIW1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Prune1Q8BIW1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Prune1Q8BIW1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Prune1Q8BIW1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Prune1Q8BIW1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Prune1Q8BIW1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Prune1Q8BIW1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Prune1Q8BIW1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Prune1Q8BIW1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Prune1Q8BIW1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Prune1Q8BIW1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Prune1Q8BIW1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Prune1Q8BIW1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Prune1Q8BIW1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Prune1Q8BIW1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Prune1Q8BIW1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Prune1Q8BIW1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Prune1Q8BIW1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Prune1Q8BIW1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Prune1Q8BIW1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Prune1Q8BIW1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Prune1Q8BIW1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Prune1Q8BIW1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Prune1Q8BIW1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Prune1Q8BIW1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Prune1Q8BIW1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Prune1Q8BIW1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Prune1Q8BIW1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Prune1Q8BIW1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Prune1Q8BIW1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Prune1Q8BIW1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Prune1Q8BIW1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Prune1Q8BIW1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Prune1Q8BIW1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms