Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH15

Cnot10, CCR4-NOT transcription complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot10Q8BH15 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cnot10Q8BH15 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cnot10Q8BH15 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cnot10Q8BH15 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cnot10Q8BH15 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cnot10Q8BH15 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cnot10Q8BH15 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cnot10Q8BH15 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Cnot10Q8BH15 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cnot10Q8BH15 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cnot10Q8BH15 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cnot10Q8BH15 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cnot10Q8BH15 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cnot10Q8BH15 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cnot10Q8BH15 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnot10Q8BH15 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnot10Q8BH15 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnot10Q8BH15 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnot10Q8BH15 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnot10Q8BH15 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cnot10Q8BH15 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cnot10Q8BH15 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cnot10Q8BH15 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnot10Q8BH15 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnot10Q8BH15 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnot10Q8BH15 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnot10Q8BH15 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnot10Q8BH15 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnot10Q8BH15 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnot10Q8BH15 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnot10Q8BH15 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cnot10Q8BH15 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cnot10Q8BH15 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cnot10Q8BH15 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cnot10Q8BH15 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cnot10Q8BH15 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Cnot10Q8BH15 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cnot10Q8BH15 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Cnot10Q8BH15 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cnot10Q8BH15 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cnot10Q8BH15 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cnot10Q8BH15 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cnot10Q8BH15 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cnot10Q8BH15 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cnot10Q8BH15 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cnot10Q8BH15 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cnot10Q8BH15 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cnot10Q8BH15 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cnot10Q8BH15 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cnot10Q8BH15 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cnot10Q8BH15 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cnot10Q8BH15 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cnot10Q8BH15 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cnot10Q8BH15 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cnot10Q8BH15 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cnot10Q8BH15 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cnot10Q8BH15 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnot10Q8BH15 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnot10Q8BH15 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnot10Q8BH15 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnot10Q8BH15 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cnot10Q8BH15 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cnot10Q8BH15 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cnot10Q8BH15 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cnot10Q8BH15 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cnot10Q8BH15 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cnot10Q8BH15 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cnot10Q8BH15 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnot10Q8BH15 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnot10Q8BH15 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnot10Q8BH15 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnot10Q8BH15 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnot10Q8BH15 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cnot10Q8BH15 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cnot10Q8BH15 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cnot10Q8BH15 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cnot10Q8BH15 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cnot10Q8BH15 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cnot10Q8BH15 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cnot10Q8BH15 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cnot10Q8BH15 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cnot10Q8BH15 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cnot10Q8BH15 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cnot10Q8BH15 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cnot10Q8BH15 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cnot10Q8BH15 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cnot10Q8BH15 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cnot10Q8BH15 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cnot10Q8BH15 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cnot10Q8BH15 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnot10Q8BH15 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnot10Q8BH15 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnot10Q8BH15 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cnot10Q8BH15 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnot10Q8BH15 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnot10Q8BH15 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnot10Q8BH15 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnot10Q8BH15 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnot10Q8BH15 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnot10Q8BH15 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms