Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGM5

Best2, Bestrophin-2, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best2Q8BGM5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Best2Q8BGM5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Best2Q8BGM5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Best2Q8BGM5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Best2Q8BGM5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Best2Q8BGM5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Best2Q8BGM5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Best2Q8BGM5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Best2Q8BGM5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Best2Q8BGM5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Best2Q8BGM5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Best2Q8BGM5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Best2Q8BGM5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Best2Q8BGM5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Best2Q8BGM5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Best2Q8BGM5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Best2Q8BGM5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Best2Q8BGM5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Best2Q8BGM5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Best2Q8BGM5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Best2Q8BGM5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Best2Q8BGM5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Best2Q8BGM5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Best2Q8BGM5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Best2Q8BGM5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Best2Q8BGM5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Best2Q8BGM5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Best2Q8BGM5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Best2Q8BGM5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Best2Q8BGM5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Best2Q8BGM5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Best2Q8BGM5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Best2Q8BGM5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Best2Q8BGM5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Best2Q8BGM5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Best2Q8BGM5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Best2Q8BGM5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Best2Q8BGM5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Best2Q8BGM5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Best2Q8BGM5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Best2Q8BGM5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Best2Q8BGM5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Best2Q8BGM5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Best2Q8BGM5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Best2Q8BGM5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Best2Q8BGM5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Best2Q8BGM5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Best2Q8BGM5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Best2Q8BGM5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Best2Q8BGM5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Best2Q8BGM5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Best2Q8BGM5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Best2Q8BGM5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Best2Q8BGM5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Best2Q8BGM5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Best2Q8BGM5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Best2Q8BGM5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Best2Q8BGM5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Best2Q8BGM5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Best2Q8BGM5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Best2Q8BGM5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Best2Q8BGM5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Best2Q8BGM5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Best2Q8BGM5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Best2Q8BGM5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Best2Q8BGM5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Best2Q8BGM5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Best2Q8BGM5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Best2Q8BGM5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Best2Q8BGM5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Best2Q8BGM5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Best2Q8BGM5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Best2Q8BGM5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Best2Q8BGM5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Best2Q8BGM5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Best2Q8BGM5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Best2Q8BGM5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Best2Q8BGM5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Best2Q8BGM5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Best2Q8BGM5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Best2Q8BGM5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Best2Q8BGM5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Best2Q8BGM5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Best2Q8BGM5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Best2Q8BGM5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Best2Q8BGM5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Best2Q8BGM5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Best2Q8BGM5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Best2Q8BGM5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Best2Q8BGM5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Best2Q8BGM5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Best2Q8BGM5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Best2Q8BGM5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Best2Q8BGM5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Best2Q8BGM5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Best2Q8BGM5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Best2Q8BGM5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Best2Q8BGM5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Best2Q8BGM5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Best2Q8BGM5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms