Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atg2bQ80XK6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atg2bQ80XK6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atg2bQ80XK6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atg2bQ80XK6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Atg2bQ80XK6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atg2bQ80XK6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atg2bQ80XK6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atg2bQ80XK6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atg2bQ80XK6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atg2bQ80XK6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atg2bQ80XK6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg2bQ80XK6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg2bQ80XK6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg2bQ80XK6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg2bQ80XK6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg2bQ80XK6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg2bQ80XK6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg2bQ80XK6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atg2bQ80XK6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atg2bQ80XK6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atg2bQ80XK6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atg2bQ80XK6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atg2bQ80XK6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Atg2bQ80XK6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atg2bQ80XK6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Atg2bQ80XK6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atg2bQ80XK6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atg2bQ80XK6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atg2bQ80XK6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Atg2bQ80XK6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atg2bQ80XK6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atg2bQ80XK6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atg2bQ80XK6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atg2bQ80XK6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atg2bQ80XK6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Atg2bQ80XK6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atg2bQ80XK6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atg2bQ80XK6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atg2bQ80XK6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atg2bQ80XK6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atg2bQ80XK6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atg2bQ80XK6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atg2bQ80XK6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atg2bQ80XK6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atg2bQ80XK6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atg2bQ80XK6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atg2bQ80XK6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atg2bQ80XK6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atg2bQ80XK6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Atg2bQ80XK6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atg2bQ80XK6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atg2bQ80XK6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atg2bQ80XK6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atg2bQ80XK6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atg2bQ80XK6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atg2bQ80XK6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atg2bQ80XK6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atg2bQ80XK6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Atg2bQ80XK6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atg2bQ80XK6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atg2bQ80XK6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atg2bQ80XK6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atg2bQ80XK6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atg2bQ80XK6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg2bQ80XK6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg2bQ80XK6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg2bQ80XK6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg2bQ80XK6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg2bQ80XK6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atg2bQ80XK6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atg2bQ80XK6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atg2bQ80XK6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atg2bQ80XK6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atg2bQ80XK6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atg2bQ80XK6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atg2bQ80XK6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atg2bQ80XK6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atg2bQ80XK6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atg2bQ80XK6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Atg2bQ80XK6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atg2bQ80XK6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atg2bQ80XK6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atg2bQ80XK6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atg2bQ80XK6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atg2bQ80XK6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atg2bQ80XK6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atg2bQ80XK6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atg2bQ80XK6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atg2bQ80XK6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atg2bQ80XK6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atg2bQ80XK6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atg2bQ80XK6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atg2bQ80XK6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atg2bQ80XK6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atg2bQ80XK6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg2bQ80XK6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg2bQ80XK6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg2bQ80XK6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg2bQ80XK6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms