Protein–RNA interactions for Protein: Q80WT0

Jph4, Junctophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jph4Q80WT0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Jph4Q80WT0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Jph4Q80WT0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Jph4Q80WT0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
Jph4Q80WT0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Jph4Q80WT0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Jph4Q80WT0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Jph4Q80WT0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
Jph4Q80WT0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
Jph4Q80WT0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Jph4Q80WT0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Jph4Q80WT0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Jph4Q80WT0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Jph4Q80WT0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Jph4Q80WT0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Jph4Q80WT0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Jph4Q80WT0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Jph4Q80WT0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Jph4Q80WT0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Jph4Q80WT0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Jph4Q80WT0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Jph4Q80WT0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Jph4Q80WT0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Jph4Q80WT0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Jph4Q80WT0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
Jph4Q80WT0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Jph4Q80WT0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Jph4Q80WT0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Jph4Q80WT0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Jph4Q80WT0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Jph4Q80WT0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Jph4Q80WT0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Jph4Q80WT0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Jph4Q80WT0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Jph4Q80WT0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Jph4Q80WT0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Jph4Q80WT0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Jph4Q80WT0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Jph4Q80WT0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Jph4Q80WT0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Jph4Q80WT0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Jph4Q80WT0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
Jph4Q80WT0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Jph4Q80WT0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Jph4Q80WT0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Jph4Q80WT0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Jph4Q80WT0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Jph4Q80WT0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Jph4Q80WT0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
Jph4Q80WT0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Jph4Q80WT0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Jph4Q80WT0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Jph4Q80WT0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Jph4Q80WT0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Jph4Q80WT0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Jph4Q80WT0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
Jph4Q80WT0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Jph4Q80WT0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Jph4Q80WT0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Jph4Q80WT0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Jph4Q80WT0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Jph4Q80WT0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Jph4Q80WT0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Jph4Q80WT0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
Jph4Q80WT0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Jph4Q80WT0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Jph4Q80WT0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Jph4Q80WT0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Jph4Q80WT0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Jph4Q80WT0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Jph4Q80WT0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Jph4Q80WT0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Jph4Q80WT0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Jph4Q80WT0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
Jph4Q80WT0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Jph4Q80WT0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Jph4Q80WT0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Jph4Q80WT0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Jph4Q80WT0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Jph4Q80WT0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
Jph4Q80WT0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Jph4Q80WT0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Jph4Q80WT0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Jph4Q80WT0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Jph4Q80WT0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Jph4Q80WT0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
Jph4Q80WT0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Jph4Q80WT0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Jph4Q80WT0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Jph4Q80WT0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Jph4Q80WT0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Jph4Q80WT0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
Jph4Q80WT0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Jph4Q80WT0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Jph4Q80WT0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
Jph4Q80WT0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Jph4Q80WT0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Jph4Q80WT0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Jph4Q80WT0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Jph4Q80WT0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms