Protein–RNA interactions for Protein: Q80W47

Wipi2, WD repeat domain phosphoinositide-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wipi2Q80W47 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Wipi2Q80W47 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Wipi2Q80W47 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Wipi2Q80W47 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Wipi2Q80W47 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Wipi2Q80W47 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Wipi2Q80W47 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Wipi2Q80W47 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Wipi2Q80W47 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Wipi2Q80W47 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Wipi2Q80W47 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Wipi2Q80W47 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Wipi2Q80W47 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Wipi2Q80W47 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Wipi2Q80W47 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Wipi2Q80W47 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Wipi2Q80W47 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Wipi2Q80W47 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Wipi2Q80W47 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Wipi2Q80W47 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Wipi2Q80W47 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Wipi2Q80W47 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Wipi2Q80W47 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Wipi2Q80W47 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Wipi2Q80W47 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Wipi2Q80W47 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Wipi2Q80W47 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Wipi2Q80W47 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Wipi2Q80W47 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Wipi2Q80W47 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Wipi2Q80W47 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Wipi2Q80W47 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Wipi2Q80W47 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Wipi2Q80W47 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Wipi2Q80W47 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Wipi2Q80W47 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Wipi2Q80W47 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Wipi2Q80W47 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Wipi2Q80W47 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Wipi2Q80W47 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Wipi2Q80W47 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Wipi2Q80W47 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Wipi2Q80W47 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Wipi2Q80W47 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Wipi2Q80W47 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Wipi2Q80W47 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Wipi2Q80W47 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Wipi2Q80W47 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Wipi2Q80W47 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Wipi2Q80W47 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Wipi2Q80W47 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Wipi2Q80W47 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Wipi2Q80W47 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Wipi2Q80W47 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Wipi2Q80W47 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Wipi2Q80W47 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Wipi2Q80W47 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Wipi2Q80W47 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Wipi2Q80W47 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Wipi2Q80W47 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Wipi2Q80W47 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Wipi2Q80W47 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Wipi2Q80W47 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Wipi2Q80W47 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Wipi2Q80W47 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Wipi2Q80W47 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Wipi2Q80W47 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Wipi2Q80W47 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Wipi2Q80W47 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Wipi2Q80W47 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Wipi2Q80W47 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Wipi2Q80W47 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Wipi2Q80W47 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Wipi2Q80W47 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Wipi2Q80W47 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Wipi2Q80W47 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Wipi2Q80W47 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Wipi2Q80W47 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Wipi2Q80W47 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Wipi2Q80W47 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Wipi2Q80W47 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Wipi2Q80W47 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Wipi2Q80W47 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Wipi2Q80W47 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Wipi2Q80W47 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Wipi2Q80W47 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Wipi2Q80W47 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Wipi2Q80W47 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Wipi2Q80W47 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Wipi2Q80W47 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Wipi2Q80W47 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Wipi2Q80W47 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Wipi2Q80W47 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Wipi2Q80W47 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Wipi2Q80W47 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Wipi2Q80W47 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Wipi2Q80W47 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Wipi2Q80W47 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Wipi2Q80W47 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Wipi2Q80W47 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138 ms