Protein–RNA interactions for Protein: Q80UG2

Plxna4, Plexin-A4, mousemouse

Predictions only

Length 1,893 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna4Q80UG2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Plxna4Q80UG2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Plxna4Q80UG2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Plxna4Q80UG2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Plxna4Q80UG2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Plxna4Q80UG2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Plxna4Q80UG2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Plxna4Q80UG2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Plxna4Q80UG2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Plxna4Q80UG2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Plxna4Q80UG2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Plxna4Q80UG2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Plxna4Q80UG2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Plxna4Q80UG2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Plxna4Q80UG2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Plxna4Q80UG2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Plxna4Q80UG2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Plxna4Q80UG2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Plxna4Q80UG2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Plxna4Q80UG2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Plxna4Q80UG2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Plxna4Q80UG2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Plxna4Q80UG2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Plxna4Q80UG2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Plxna4Q80UG2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Plxna4Q80UG2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Plxna4Q80UG2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Plxna4Q80UG2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Plxna4Q80UG2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Plxna4Q80UG2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Plxna4Q80UG2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Plxna4Q80UG2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Plxna4Q80UG2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Plxna4Q80UG2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Plxna4Q80UG2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Plxna4Q80UG2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Plxna4Q80UG2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Plxna4Q80UG2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Plxna4Q80UG2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Plxna4Q80UG2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Plxna4Q80UG2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Plxna4Q80UG2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Plxna4Q80UG2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Plxna4Q80UG2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Plxna4Q80UG2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Plxna4Q80UG2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Plxna4Q80UG2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Plxna4Q80UG2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Plxna4Q80UG2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Plxna4Q80UG2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Plxna4Q80UG2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Plxna4Q80UG2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Plxna4Q80UG2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Plxna4Q80UG2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Plxna4Q80UG2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Plxna4Q80UG2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Plxna4Q80UG2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Plxna4Q80UG2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Plxna4Q80UG2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Plxna4Q80UG2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Plxna4Q80UG2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Plxna4Q80UG2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Plxna4Q80UG2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Plxna4Q80UG2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Plxna4Q80UG2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Plxna4Q80UG2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Plxna4Q80UG2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Plxna4Q80UG2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Plxna4Q80UG2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Plxna4Q80UG2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plxna4Q80UG2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plxna4Q80UG2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Plxna4Q80UG2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Plxna4Q80UG2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Plxna4Q80UG2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Plxna4Q80UG2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Plxna4Q80UG2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Plxna4Q80UG2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plxna4Q80UG2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Plxna4Q80UG2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plxna4Q80UG2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plxna4Q80UG2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plxna4Q80UG2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Plxna4Q80UG2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Plxna4Q80UG2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Plxna4Q80UG2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Plxna4Q80UG2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Plxna4Q80UG2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Plxna4Q80UG2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Plxna4Q80UG2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Plxna4Q80UG2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Plxna4Q80UG2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Plxna4Q80UG2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Plxna4Q80UG2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Plxna4Q80UG2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Plxna4Q80UG2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Plxna4Q80UG2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Plxna4Q80UG2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Plxna4Q80UG2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Plxna4Q80UG2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms