Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Avl9Q80U56 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Avl9Q80U56 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Avl9Q80U56 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Avl9Q80U56 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Avl9Q80U56 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Avl9Q80U56 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Avl9Q80U56 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Avl9Q80U56 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Avl9Q80U56 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Avl9Q80U56 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Avl9Q80U56 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Avl9Q80U56 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Avl9Q80U56 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Avl9Q80U56 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Avl9Q80U56 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Avl9Q80U56 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Avl9Q80U56 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Avl9Q80U56 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Avl9Q80U56 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Avl9Q80U56 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Avl9Q80U56 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Avl9Q80U56 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Avl9Q80U56 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Avl9Q80U56 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Avl9Q80U56 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Avl9Q80U56 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Avl9Q80U56 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Avl9Q80U56 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Avl9Q80U56 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Avl9Q80U56 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Avl9Q80U56 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Avl9Q80U56 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Avl9Q80U56 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Avl9Q80U56 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Avl9Q80U56 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Avl9Q80U56 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Avl9Q80U56 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Avl9Q80U56 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Avl9Q80U56 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Avl9Q80U56 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Avl9Q80U56 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Avl9Q80U56 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Avl9Q80U56 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Avl9Q80U56 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Avl9Q80U56 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Avl9Q80U56 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Avl9Q80U56 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Avl9Q80U56 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Avl9Q80U56 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Avl9Q80U56 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Avl9Q80U56 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Avl9Q80U56 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Avl9Q80U56 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Avl9Q80U56 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Avl9Q80U56 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Avl9Q80U56 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Avl9Q80U56 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Avl9Q80U56 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Avl9Q80U56 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Avl9Q80U56 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Avl9Q80U56 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Avl9Q80U56 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Avl9Q80U56 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Avl9Q80U56 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Avl9Q80U56 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Avl9Q80U56 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Avl9Q80U56 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Avl9Q80U56 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Avl9Q80U56 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Avl9Q80U56 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Avl9Q80U56 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Avl9Q80U56 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Avl9Q80U56 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Avl9Q80U56 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Avl9Q80U56 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Avl9Q80U56 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Avl9Q80U56 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Avl9Q80U56 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Avl9Q80U56 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Avl9Q80U56 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Avl9Q80U56 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Avl9Q80U56 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Avl9Q80U56 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Avl9Q80U56 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Avl9Q80U56 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Avl9Q80U56 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Avl9Q80U56 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Avl9Q80U56 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Avl9Q80U56 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Avl9Q80U56 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Avl9Q80U56 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Avl9Q80U56 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Avl9Q80U56 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Avl9Q80U56 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Avl9Q80U56 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Avl9Q80U56 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Avl9Q80U56 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Avl9Q80U56 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Avl9Q80U56 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms