Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT28

Rexo1, RNA exonuclease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo1Q7TT28 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Rexo1Q7TT28 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rexo1Q7TT28 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rexo1Q7TT28 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rexo1Q7TT28 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rexo1Q7TT28 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rexo1Q7TT28 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rexo1Q7TT28 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rexo1Q7TT28 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rexo1Q7TT28 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rexo1Q7TT28 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rexo1Q7TT28 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rexo1Q7TT28 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rexo1Q7TT28 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rexo1Q7TT28 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rexo1Q7TT28 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rexo1Q7TT28 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rexo1Q7TT28 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rexo1Q7TT28 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rexo1Q7TT28 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rexo1Q7TT28 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rexo1Q7TT28 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rexo1Q7TT28 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rexo1Q7TT28 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rexo1Q7TT28 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rexo1Q7TT28 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rexo1Q7TT28 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rexo1Q7TT28 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Rexo1Q7TT28 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rexo1Q7TT28 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rexo1Q7TT28 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rexo1Q7TT28 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rexo1Q7TT28 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rexo1Q7TT28 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rexo1Q7TT28 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rexo1Q7TT28 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rexo1Q7TT28 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rexo1Q7TT28 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rexo1Q7TT28 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Rexo1Q7TT28 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rexo1Q7TT28 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rexo1Q7TT28 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rexo1Q7TT28 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rexo1Q7TT28 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rexo1Q7TT28 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rexo1Q7TT28 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rexo1Q7TT28 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rexo1Q7TT28 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rexo1Q7TT28 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rexo1Q7TT28 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rexo1Q7TT28 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rexo1Q7TT28 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rexo1Q7TT28 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rexo1Q7TT28 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rexo1Q7TT28 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rexo1Q7TT28 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rexo1Q7TT28 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rexo1Q7TT28 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rexo1Q7TT28 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rexo1Q7TT28 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rexo1Q7TT28 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rexo1Q7TT28 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Rexo1Q7TT28 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rexo1Q7TT28 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rexo1Q7TT28 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rexo1Q7TT28 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Rexo1Q7TT28 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rexo1Q7TT28 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rexo1Q7TT28 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rexo1Q7TT28 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rexo1Q7TT28 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rexo1Q7TT28 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rexo1Q7TT28 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rexo1Q7TT28 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rexo1Q7TT28 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rexo1Q7TT28 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rexo1Q7TT28 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rexo1Q7TT28 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rexo1Q7TT28 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rexo1Q7TT28 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rexo1Q7TT28 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rexo1Q7TT28 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rexo1Q7TT28 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rexo1Q7TT28 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rexo1Q7TT28 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rexo1Q7TT28 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rexo1Q7TT28 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Rexo1Q7TT28 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rexo1Q7TT28 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rexo1Q7TT28 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rexo1Q7TT28 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rexo1Q7TT28 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rexo1Q7TT28 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rexo1Q7TT28 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rexo1Q7TT28 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rexo1Q7TT28 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rexo1Q7TT28 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rexo1Q7TT28 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rexo1Q7TT28 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rexo1Q7TT28 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.5 ms