Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dsg1bQ7TSF1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dsg1bQ7TSF1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dsg1bQ7TSF1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dsg1bQ7TSF1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dsg1bQ7TSF1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dsg1bQ7TSF1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dsg1bQ7TSF1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dsg1bQ7TSF1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dsg1bQ7TSF1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dsg1bQ7TSF1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dsg1bQ7TSF1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dsg1bQ7TSF1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dsg1bQ7TSF1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dsg1bQ7TSF1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dsg1bQ7TSF1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dsg1bQ7TSF1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dsg1bQ7TSF1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Dsg1bQ7TSF1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dsg1bQ7TSF1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dsg1bQ7TSF1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Dsg1bQ7TSF1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dsg1bQ7TSF1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Dsg1bQ7TSF1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dsg1bQ7TSF1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dsg1bQ7TSF1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dsg1bQ7TSF1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dsg1bQ7TSF1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dsg1bQ7TSF1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dsg1bQ7TSF1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Dsg1bQ7TSF1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Dsg1bQ7TSF1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dsg1bQ7TSF1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Dsg1bQ7TSF1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dsg1bQ7TSF1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dsg1bQ7TSF1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Dsg1bQ7TSF1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dsg1bQ7TSF1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dsg1bQ7TSF1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dsg1bQ7TSF1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dsg1bQ7TSF1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Dsg1bQ7TSF1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dsg1bQ7TSF1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dsg1bQ7TSF1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dsg1bQ7TSF1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dsg1bQ7TSF1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dsg1bQ7TSF1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Dsg1bQ7TSF1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dsg1bQ7TSF1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dsg1bQ7TSF1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dsg1bQ7TSF1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dsg1bQ7TSF1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dsg1bQ7TSF1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dsg1bQ7TSF1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dsg1bQ7TSF1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dsg1bQ7TSF1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dsg1bQ7TSF1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dsg1bQ7TSF1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dsg1bQ7TSF1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dsg1bQ7TSF1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dsg1bQ7TSF1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dsg1bQ7TSF1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dsg1bQ7TSF1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Dsg1bQ7TSF1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dsg1bQ7TSF1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dsg1bQ7TSF1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dsg1bQ7TSF1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Dsg1bQ7TSF1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dsg1bQ7TSF1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dsg1bQ7TSF1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dsg1bQ7TSF1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dsg1bQ7TSF1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dsg1bQ7TSF1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dsg1bQ7TSF1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dsg1bQ7TSF1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dsg1bQ7TSF1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dsg1bQ7TSF1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dsg1bQ7TSF1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dsg1bQ7TSF1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dsg1bQ7TSF1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dsg1bQ7TSF1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Dsg1bQ7TSF1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dsg1bQ7TSF1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dsg1bQ7TSF1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Dsg1bQ7TSF1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dsg1bQ7TSF1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dsg1bQ7TSF1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms